Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHRNA7P36544 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHRNA7P36544 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHRNA7P36544 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHRNA7P36544 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNA7P36544 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNA7P36544 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNA7P36544 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNA7P36544 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNA7P36544 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA7P36544 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA7P36544 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA7P36544 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA7P36544 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA7P36544 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA7P36544 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA7P36544 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA7P36544 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA7P36544 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA7P36544 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA7P36544 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA7P36544 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA7P36544 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA7P36544 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA7P36544 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA7P36544 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA7P36544 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA7P36544 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNA7P36544 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNA7P36544 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNA7P36544 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHRNA7P36544 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
CHRNA7P36544 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHRNA7P36544 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHRNA7P36544 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNA7P36544 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNA7P36544 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNA7P36544 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNA7P36544 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNA7P36544 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNA7P36544 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA7P36544 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA7P36544 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA7P36544 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA7P36544 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA7P36544 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA7P36544 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA7P36544 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA7P36544 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA7P36544 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA7P36544 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA7P36544 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA7P36544 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA7P36544 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA7P36544 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA7P36544 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA7P36544 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA7P36544 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA7P36544 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA7P36544 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA7P36544 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNA7P36544 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNA7P36544 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNA7P36544 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNA7P36544 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNA7P36544 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CHRNA7P36544 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHRNA7P36544 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHRNA7P36544 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHRNA7P36544 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHRNA7P36544 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHRNA7P36544 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHRNA7P36544 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHRNA7P36544 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHRNA7P36544 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHRNA7P36544 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHRNA7P36544 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHRNA7P36544 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHRNA7P36544 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHRNA7P36544 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHRNA7P36544 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHRNA7P36544 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHRNA7P36544 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHRNA7P36544 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNA7P36544 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNA7P36544 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNA7P36544 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNA7P36544 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNA7P36544 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHRNA7P36544 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHRNA7P36544 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CHRNA7P36544 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CHRNA7P36544 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHRNA7P36544 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHRNA7P36544 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHRNA7P36544 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHRNA7P36544 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHRNA7P36544 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHRNA7P36544 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CHRNA7P36544 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms