Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP6V1E1P36543 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP6V1E1P36543 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP6V1E1P36543 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP6V1E1P36543 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP6V1E1P36543 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP6V1E1P36543 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP6V1E1P36543 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP6V1E1P36543 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP6V1E1P36543 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP6V1E1P36543 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP6V1E1P36543 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP6V1E1P36543 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP6V1E1P36543 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP6V1E1P36543 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP6V1E1P36543 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP6V1E1P36543 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP6V1E1P36543 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP6V1E1P36543 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP6V1E1P36543 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP6V1E1P36543 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP6V1E1P36543 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP6V1E1P36543 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP6V1E1P36543 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP6V1E1P36543 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP6V1E1P36543 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP6V1E1P36543 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ATP6V1E1P36543 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP6V1E1P36543 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP6V1E1P36543 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP6V1E1P36543 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP6V1E1P36543 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP6V1E1P36543 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP6V1E1P36543 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP6V1E1P36543 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP6V1E1P36543 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP6V1E1P36543 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP6V1E1P36543 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP6V1E1P36543 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP6V1E1P36543 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP6V1E1P36543 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP6V1E1P36543 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP6V1E1P36543 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP6V1E1P36543 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP6V1E1P36543 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP6V1E1P36543 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP6V1E1P36543 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP6V1E1P36543 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP6V1E1P36543 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP6V1E1P36543 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP6V1E1P36543 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP6V1E1P36543 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP6V1E1P36543 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP6V1E1P36543 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP6V1E1P36543 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP6V1E1P36543 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP6V1E1P36543 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP6V1E1P36543 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP6V1E1P36543 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP6V1E1P36543 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP6V1E1P36543 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP6V1E1P36543 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP6V1E1P36543 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP6V1E1P36543 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP6V1E1P36543 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP6V1E1P36543 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP6V1E1P36543 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP6V1E1P36543 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP6V1E1P36543 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP6V1E1P36543 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP6V1E1P36543 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP6V1E1P36543 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP6V1E1P36543 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP6V1E1P36543 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP6V1E1P36543 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP6V1E1P36543 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP6V1E1P36543 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP6V1E1P36543 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP6V1E1P36543 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP6V1E1P36543 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP6V1E1P36543 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP6V1E1P36543 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP6V1E1P36543 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP6V1E1P36543 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP6V1E1P36543 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP6V1E1P36543 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP6V1E1P36543 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP6V1E1P36543 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP6V1E1P36543 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP6V1E1P36543 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP6V1E1P36543 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP6V1E1P36543 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP6V1E1P36543 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP6V1E1P36543 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP6V1E1P36543 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP6V1E1P36543 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP6V1E1P36543 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP6V1E1P36543 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP6V1E1P36543 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP6V1E1P36543 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms