Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARL3P36405 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARL3P36405 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARL3P36405 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARL3P36405 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARL3P36405 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARL3P36405 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ARL3P36405 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARL3P36405 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARL3P36405 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARL3P36405 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARL3P36405 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARL3P36405 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ARL3P36405 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARL3P36405 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARL3P36405 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARL3P36405 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARL3P36405 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARL3P36405 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARL3P36405 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARL3P36405 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARL3P36405 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARL3P36405 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARL3P36405 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARL3P36405 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ARL3P36405 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARL3P36405 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARL3P36405 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARL3P36405 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARL3P36405 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARL3P36405 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ARL3P36405 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARL3P36405 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARL3P36405 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARL3P36405 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARL3P36405 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARL3P36405 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARL3P36405 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARL3P36405 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARL3P36405 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARL3P36405 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARL3P36405 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARL3P36405 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARL3P36405 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARL3P36405 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARL3P36405 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARL3P36405 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARL3P36405 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARL3P36405 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARL3P36405 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARL3P36405 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL3P36405 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL3P36405 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL3P36405 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL3P36405 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL3P36405 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL3P36405 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL3P36405 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL3P36405 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL3P36405 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL3P36405 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARL3P36405 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARL3P36405 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARL3P36405 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARL3P36405 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARL3P36405 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARL3P36405 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARL3P36405 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARL3P36405 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARL3P36405 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARL3P36405 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARL3P36405 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARL3P36405 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARL3P36405 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ARL3P36405 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARL3P36405 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARL3P36405 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARL3P36405 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL3P36405 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL3P36405 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL3P36405 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL3P36405 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL3P36405 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL3P36405 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL3P36405 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL3P36405 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL3P36405 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL3P36405 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL3P36405 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL3P36405 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL3P36405 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL3P36405 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL3P36405 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL3P36405 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL3P36405 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL3P36405 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL3P36405 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARL3P36405 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARL3P36405 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARL3P36405 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms