Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
KRT2P35908 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
KRT2P35908 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KRT2P35908 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
KRT2P35908 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KRT2P35908 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KRT2P35908 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KRT2P35908 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KRT2P35908 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KRT2P35908 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KRT2P35908 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KRT2P35908 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KRT2P35908 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KRT2P35908 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KRT2P35908 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KRT2P35908 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
KRT2P35908 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KRT2P35908 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KRT2P35908 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KRT2P35908 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KRT2P35908 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KRT2P35908 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KRT2P35908 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KRT2P35908 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KRT2P35908 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
KRT2P35908 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KRT2P35908 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KRT2P35908 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
KRT2P35908 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KRT2P35908 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
KRT2P35908 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
KRT2P35908 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KRT2P35908 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KRT2P35908 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KRT2P35908 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KRT2P35908 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
KRT2P35908 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KRT2P35908 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KRT2P35908 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KRT2P35908 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KRT2P35908 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KRT2P35908 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KRT2P35908 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KRT2P35908 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KRT2P35908 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
KRT2P35908 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
KRT2P35908 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
KRT2P35908 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KRT2P35908 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KRT2P35908 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KRT2P35908 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KRT2P35908 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KRT2P35908 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KRT2P35908 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KRT2P35908 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KRT2P35908 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KRT2P35908 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KRT2P35908 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KRT2P35908 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KRT2P35908 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KRT2P35908 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KRT2P35908 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KRT2P35908 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KRT2P35908 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KRT2P35908 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KRT2P35908 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KRT2P35908 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KRT2P35908 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KRT2P35908 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KRT2P35908 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KRT2P35908 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KRT2P35908 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KRT2P35908 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KRT2P35908 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KRT2P35908 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KRT2P35908 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
KRT2P35908 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KRT2P35908 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KRT2P35908 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KRT2P35908 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KRT2P35908 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KRT2P35908 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KRT2P35908 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KRT2P35908 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
KRT2P35908 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KRT2P35908 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KRT2P35908 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KRT2P35908 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KRT2P35908 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KRT2P35908 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KRT2P35908 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KRT2P35908 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KRT2P35908 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KRT2P35908 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KRT2P35908 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
KRT2P35908 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
KRT2P35908 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KRT2P35908 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
KRT2P35908 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KRT2P35908 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms