Protein–RNA interactions for Protein: P35790

CHKA, Choline kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKAP35790 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CHKAP35790 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHKAP35790 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHKAP35790 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHKAP35790 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHKAP35790 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHKAP35790 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHKAP35790 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHKAP35790 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CHKAP35790 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHKAP35790 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHKAP35790 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHKAP35790 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHKAP35790 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHKAP35790 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHKAP35790 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHKAP35790 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHKAP35790 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHKAP35790 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHKAP35790 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHKAP35790 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHKAP35790 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHKAP35790 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CHKAP35790 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHKAP35790 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CHKAP35790 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHKAP35790 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHKAP35790 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHKAP35790 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHKAP35790 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHKAP35790 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHKAP35790 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHKAP35790 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHKAP35790 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHKAP35790 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHKAP35790 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHKAP35790 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHKAP35790 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHKAP35790 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHKAP35790 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHKAP35790 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHKAP35790 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHKAP35790 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHKAP35790 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHKAP35790 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHKAP35790 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHKAP35790 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHKAP35790 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHKAP35790 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHKAP35790 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHKAP35790 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHKAP35790 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHKAP35790 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHKAP35790 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHKAP35790 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHKAP35790 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHKAP35790 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHKAP35790 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHKAP35790 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHKAP35790 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHKAP35790 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHKAP35790 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHKAP35790 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHKAP35790 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHKAP35790 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHKAP35790 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHKAP35790 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHKAP35790 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHKAP35790 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHKAP35790 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHKAP35790 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHKAP35790 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHKAP35790 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHKAP35790 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHKAP35790 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHKAP35790 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHKAP35790 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHKAP35790 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHKAP35790 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHKAP35790 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHKAP35790 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CHKAP35790 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHKAP35790 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHKAP35790 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHKAP35790 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHKAP35790 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHKAP35790 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHKAP35790 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHKAP35790 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHKAP35790 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHKAP35790 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHKAP35790 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHKAP35790 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHKAP35790 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHKAP35790 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHKAP35790 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHKAP35790 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHKAP35790 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHKAP35790 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHKAP35790 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 192.1 ms