Protein–RNA interactions for Protein: P35442

THBS2, Thrombospondin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS2P35442 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THBS2P35442 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THBS2P35442 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THBS2P35442 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THBS2P35442 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
THBS2P35442 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THBS2P35442 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THBS2P35442 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THBS2P35442 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THBS2P35442 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THBS2P35442 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
THBS2P35442 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THBS2P35442 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THBS2P35442 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THBS2P35442 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
THBS2P35442 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
THBS2P35442 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
THBS2P35442 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
THBS2P35442 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
THBS2P35442 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THBS2P35442 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
THBS2P35442 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
THBS2P35442 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
THBS2P35442 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THBS2P35442 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THBS2P35442 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THBS2P35442 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THBS2P35442 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
THBS2P35442 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THBS2P35442 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
THBS2P35442 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THBS2P35442 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THBS2P35442 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THBS2P35442 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
THBS2P35442 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
THBS2P35442 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THBS2P35442 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
THBS2P35442 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THBS2P35442 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
THBS2P35442 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
THBS2P35442 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
THBS2P35442 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
THBS2P35442 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
THBS2P35442 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
THBS2P35442 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THBS2P35442 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THBS2P35442 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THBS2P35442 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THBS2P35442 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THBS2P35442 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THBS2P35442 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THBS2P35442 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THBS2P35442 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THBS2P35442 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THBS2P35442 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THBS2P35442 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THBS2P35442 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THBS2P35442 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THBS2P35442 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THBS2P35442 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THBS2P35442 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THBS2P35442 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THBS2P35442 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THBS2P35442 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
THBS2P35442 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
THBS2P35442 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
THBS2P35442 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THBS2P35442 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THBS2P35442 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THBS2P35442 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THBS2P35442 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THBS2P35442 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THBS2P35442 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
THBS2P35442 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THBS2P35442 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THBS2P35442 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
THBS2P35442 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
THBS2P35442 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
THBS2P35442 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
THBS2P35442 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THBS2P35442 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THBS2P35442 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THBS2P35442 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THBS2P35442 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THBS2P35442 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THBS2P35442 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
THBS2P35442 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
THBS2P35442 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
THBS2P35442 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
THBS2P35442 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THBS2P35442 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THBS2P35442 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THBS2P35442 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
THBS2P35442 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
THBS2P35442 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
THBS2P35442 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
THBS2P35442 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
THBS2P35442 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
THBS2P35442 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THBS2P35442 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms