Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BMI1P35226 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BMI1P35226 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BMI1P35226 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BMI1P35226 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BMI1P35226 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BMI1P35226 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BMI1P35226 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BMI1P35226 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BMI1P35226 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BMI1P35226 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BMI1P35226 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
BMI1P35226 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BMI1P35226 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
BMI1P35226 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BMI1P35226 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BMI1P35226 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BMI1P35226 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BMI1P35226 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BMI1P35226 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BMI1P35226 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BMI1P35226 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BMI1P35226 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BMI1P35226 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BMI1P35226 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BMI1P35226 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BMI1P35226 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BMI1P35226 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BMI1P35226 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BMI1P35226 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BMI1P35226 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BMI1P35226 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BMI1P35226 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BMI1P35226 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BMI1P35226 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BMI1P35226 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BMI1P35226 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
BMI1P35226 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BMI1P35226 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BMI1P35226 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BMI1P35226 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BMI1P35226 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BMI1P35226 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BMI1P35226 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BMI1P35226 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BMI1P35226 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
BMI1P35226 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BMI1P35226 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BMI1P35226 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BMI1P35226 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BMI1P35226 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BMI1P35226 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BMI1P35226 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BMI1P35226 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
BMI1P35226 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BMI1P35226 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BMI1P35226 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BMI1P35226 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BMI1P35226 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BMI1P35226 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BMI1P35226 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BMI1P35226 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BMI1P35226 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BMI1P35226 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BMI1P35226 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BMI1P35226 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BMI1P35226 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BMI1P35226 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BMI1P35226 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BMI1P35226 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BMI1P35226 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BMI1P35226 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BMI1P35226 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BMI1P35226 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BMI1P35226 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BMI1P35226 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
BMI1P35226 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BMI1P35226 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BMI1P35226 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BMI1P35226 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BMI1P35226 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BMI1P35226 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BMI1P35226 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BMI1P35226 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BMI1P35226 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BMI1P35226 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BMI1P35226 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
BMI1P35226 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BMI1P35226 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BMI1P35226 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BMI1P35226 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BMI1P35226 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BMI1P35226 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BMI1P35226 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BMI1P35226 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BMI1P35226 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BMI1P35226 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BMI1P35226 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
BMI1P35226 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BMI1P35226 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms