Protein–RNA interactions for Protein: P35173

Stfa3, Stefin-3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa3P35173 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stfa3P35173 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stfa3P35173 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stfa3P35173 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stfa3P35173 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stfa3P35173 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stfa3P35173 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Stfa3P35173 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stfa3P35173 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stfa3P35173 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stfa3P35173 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Stfa3P35173 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stfa3P35173 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stfa3P35173 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stfa3P35173 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stfa3P35173 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stfa3P35173 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stfa3P35173 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stfa3P35173 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stfa3P35173 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stfa3P35173 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stfa3P35173 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stfa3P35173 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stfa3P35173 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stfa3P35173 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stfa3P35173 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stfa3P35173 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Stfa3P35173 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stfa3P35173 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Stfa3P35173 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stfa3P35173 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stfa3P35173 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Stfa3P35173 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stfa3P35173 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stfa3P35173 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stfa3P35173 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stfa3P35173 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stfa3P35173 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stfa3P35173 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Stfa3P35173 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Stfa3P35173 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Stfa3P35173 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Stfa3P35173 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Stfa3P35173 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Stfa3P35173 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stfa3P35173 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stfa3P35173 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stfa3P35173 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stfa3P35173 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stfa3P35173 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stfa3P35173 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stfa3P35173 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Stfa3P35173 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Stfa3P35173 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stfa3P35173 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stfa3P35173 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stfa3P35173 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stfa3P35173 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stfa3P35173 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Stfa3P35173 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Stfa3P35173 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Stfa3P35173 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Stfa3P35173 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Stfa3P35173 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stfa3P35173 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stfa3P35173 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stfa3P35173 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stfa3P35173 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stfa3P35173 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stfa3P35173 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stfa3P35173 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stfa3P35173 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stfa3P35173 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stfa3P35173 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stfa3P35173 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stfa3P35173 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stfa3P35173 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stfa3P35173 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stfa3P35173 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stfa3P35173 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stfa3P35173 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Stfa3P35173 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stfa3P35173 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stfa3P35173 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stfa3P35173 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stfa3P35173 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stfa3P35173 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stfa3P35173 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stfa3P35173 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stfa3P35173 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stfa3P35173 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stfa3P35173 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stfa3P35173 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stfa3P35173 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Stfa3P35173 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Stfa3P35173 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Stfa3P35173 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Stfa3P35173 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Stfa3P35173 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Stfa3P35173 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms