Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCD1P33897 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCD1P33897 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCD1P33897 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCD1P33897 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCD1P33897 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCD1P33897 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCD1P33897 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCD1P33897 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCD1P33897 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCD1P33897 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCD1P33897 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCD1P33897 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCD1P33897 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCD1P33897 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCD1P33897 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCD1P33897 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCD1P33897 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCD1P33897 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ABCD1P33897 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCD1P33897 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCD1P33897 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCD1P33897 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCD1P33897 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCD1P33897 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCD1P33897 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCD1P33897 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCD1P33897 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCD1P33897 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCD1P33897 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCD1P33897 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCD1P33897 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCD1P33897 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCD1P33897 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCD1P33897 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCD1P33897 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCD1P33897 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCD1P33897 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCD1P33897 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCD1P33897 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCD1P33897 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCD1P33897 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCD1P33897 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCD1P33897 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCD1P33897 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCD1P33897 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCD1P33897 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCD1P33897 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCD1P33897 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCD1P33897 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCD1P33897 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCD1P33897 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCD1P33897 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCD1P33897 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCD1P33897 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCD1P33897 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCD1P33897 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCD1P33897 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCD1P33897 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCD1P33897 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCD1P33897 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCD1P33897 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCD1P33897 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCD1P33897 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCD1P33897 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCD1P33897 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCD1P33897 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCD1P33897 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCD1P33897 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCD1P33897 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCD1P33897 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCD1P33897 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCD1P33897 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCD1P33897 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCD1P33897 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCD1P33897 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCD1P33897 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCD1P33897 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCD1P33897 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCD1P33897 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCD1P33897 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCD1P33897 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCD1P33897 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCD1P33897 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCD1P33897 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCD1P33897 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCD1P33897 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCD1P33897 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCD1P33897 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCD1P33897 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCD1P33897 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCD1P33897 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCD1P33897 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCD1P33897 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCD1P33897 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCD1P33897 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCD1P33897 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCD1P33897 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCD1P33897 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCD1P33897 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.5 ms