Protein–RNA interactions for Protein: P32881

IFNA8, Interferon alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA8P32881 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFNA8P32881 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFNA8P32881 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFNA8P32881 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFNA8P32881 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFNA8P32881 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFNA8P32881 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFNA8P32881 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFNA8P32881 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFNA8P32881 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFNA8P32881 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IFNA8P32881 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFNA8P32881 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFNA8P32881 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFNA8P32881 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFNA8P32881 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFNA8P32881 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFNA8P32881 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFNA8P32881 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFNA8P32881 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFNA8P32881 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFNA8P32881 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFNA8P32881 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFNA8P32881 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFNA8P32881 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFNA8P32881 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFNA8P32881 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFNA8P32881 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFNA8P32881 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFNA8P32881 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFNA8P32881 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFNA8P32881 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
IFNA8P32881 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFNA8P32881 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFNA8P32881 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFNA8P32881 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFNA8P32881 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFNA8P32881 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFNA8P32881 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFNA8P32881 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFNA8P32881 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFNA8P32881 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFNA8P32881 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
IFNA8P32881 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFNA8P32881 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFNA8P32881 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
IFNA8P32881 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFNA8P32881 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFNA8P32881 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFNA8P32881 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFNA8P32881 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFNA8P32881 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFNA8P32881 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFNA8P32881 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFNA8P32881 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFNA8P32881 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFNA8P32881 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFNA8P32881 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNA8P32881 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNA8P32881 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFNA8P32881 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFNA8P32881 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFNA8P32881 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFNA8P32881 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFNA8P32881 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFNA8P32881 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFNA8P32881 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFNA8P32881 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFNA8P32881 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFNA8P32881 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFNA8P32881 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFNA8P32881 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFNA8P32881 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFNA8P32881 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFNA8P32881 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNA8P32881 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNA8P32881 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNA8P32881 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNA8P32881 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNA8P32881 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNA8P32881 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNA8P32881 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNA8P32881 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNA8P32881 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFNA8P32881 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFNA8P32881 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFNA8P32881 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFNA8P32881 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFNA8P32881 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFNA8P32881 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFNA8P32881 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFNA8P32881 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFNA8P32881 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFNA8P32881 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFNA8P32881 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFNA8P32881 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFNA8P32881 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
IFNA8P32881 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFNA8P32881 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
IFNA8P32881 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms