Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GBP2P32456 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GBP2P32456 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GBP2P32456 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
GBP2P32456 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GBP2P32456 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GBP2P32456 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GBP2P32456 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GBP2P32456 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GBP2P32456 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GBP2P32456 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GBP2P32456 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GBP2P32456 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GBP2P32456 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GBP2P32456 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GBP2P32456 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GBP2P32456 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GBP2P32456 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GBP2P32456 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GBP2P32456 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GBP2P32456 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GBP2P32456 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GBP2P32456 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GBP2P32456 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GBP2P32456 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GBP2P32456 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GBP2P32456 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GBP2P32456 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GBP2P32456 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GBP2P32456 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GBP2P32456 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GBP2P32456 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GBP2P32456 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GBP2P32456 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GBP2P32456 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GBP2P32456 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GBP2P32456 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GBP2P32456 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GBP2P32456 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GBP2P32456 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GBP2P32456 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GBP2P32456 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GBP2P32456 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GBP2P32456 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GBP2P32456 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GBP2P32456 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GBP2P32456 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GBP2P32456 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GBP2P32456 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GBP2P32456 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GBP2P32456 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GBP2P32456 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GBP2P32456 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GBP2P32456 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GBP2P32456 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GBP2P32456 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GBP2P32456 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GBP2P32456 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GBP2P32456 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GBP2P32456 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GBP2P32456 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GBP2P32456 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GBP2P32456 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GBP2P32456 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GBP2P32456 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GBP2P32456 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GBP2P32456 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GBP2P32456 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GBP2P32456 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GBP2P32456 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GBP2P32456 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GBP2P32456 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GBP2P32456 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GBP2P32456 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GBP2P32456 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GBP2P32456 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
GBP2P32456 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
GBP2P32456 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GBP2P32456 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GBP2P32456 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GBP2P32456 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GBP2P32456 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GBP2P32456 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GBP2P32456 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GBP2P32456 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GBP2P32456 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GBP2P32456 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GBP2P32456 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GBP2P32456 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GBP2P32456 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GBP2P32456 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GBP2P32456 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GBP2P32456 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GBP2P32456 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GBP2P32456 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GBP2P32456 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GBP2P32456 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GBP2P32456 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GBP2P32456 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GBP2P32456 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms