Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CASQ1P31415 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CASQ1P31415 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
CASQ1P31415 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CASQ1P31415 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CASQ1P31415 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CASQ1P31415 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CASQ1P31415 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CASQ1P31415 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CASQ1P31415 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CASQ1P31415 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CASQ1P31415 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CASQ1P31415 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CASQ1P31415 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CASQ1P31415 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CASQ1P31415 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CASQ1P31415 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CASQ1P31415 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CASQ1P31415 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CASQ1P31415 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASQ1P31415 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASQ1P31415 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASQ1P31415 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASQ1P31415 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASQ1P31415 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASQ1P31415 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CASQ1P31415 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CASQ1P31415 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CASQ1P31415 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CASQ1P31415 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CASQ1P31415 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CASQ1P31415 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CASQ1P31415 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASQ1P31415 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASQ1P31415 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASQ1P31415 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASQ1P31415 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASQ1P31415 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASQ1P31415 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CASQ1P31415 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CASQ1P31415 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CASQ1P31415 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CASQ1P31415 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CASQ1P31415 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CASQ1P31415 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CASQ1P31415 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CASQ1P31415 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CASQ1P31415 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASQ1P31415 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASQ1P31415 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASQ1P31415 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASQ1P31415 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASQ1P31415 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASQ1P31415 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASQ1P31415 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASQ1P31415 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASQ1P31415 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASQ1P31415 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASQ1P31415 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASQ1P31415 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASQ1P31415 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASQ1P31415 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CASQ1P31415 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASQ1P31415 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASQ1P31415 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASQ1P31415 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASQ1P31415 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASQ1P31415 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASQ1P31415 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CASQ1P31415 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CASQ1P31415 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CASQ1P31415 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CASQ1P31415 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CASQ1P31415 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CASQ1P31415 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CASQ1P31415 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CASQ1P31415 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CASQ1P31415 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CASQ1P31415 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CASQ1P31415 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CASQ1P31415 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CASQ1P31415 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
CASQ1P31415 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CASQ1P31415 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CASQ1P31415 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CASQ1P31415 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CASQ1P31415 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CASQ1P31415 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CASQ1P31415 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CASQ1P31415 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CASQ1P31415 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CASQ1P31415 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CASQ1P31415 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CASQ1P31415 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CASQ1P31415 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CASQ1P31415 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CASQ1P31415 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CASQ1P31415 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CASQ1P31415 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CASQ1P31415 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms