Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HOXA7P31268 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
HOXA7P31268 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
HOXA7P31268 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HOXA7P31268 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HOXA7P31268 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
HOXA7P31268 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
HOXA7P31268 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
HOXA7P31268 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
HOXA7P31268 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
HOXA7P31268 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
HOXA7P31268 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
HOXA7P31268 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HOXA7P31268 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HOXA7P31268 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
HOXA7P31268 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
HOXA7P31268 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HOXA7P31268 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
HOXA7P31268 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
HOXA7P31268 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
HOXA7P31268 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HOXA7P31268 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
HOXA7P31268 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HOXA7P31268 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HOXA7P31268 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HOXA7P31268 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HOXA7P31268 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HOXA7P31268 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
HOXA7P31268 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HOXA7P31268 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HOXA7P31268 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
HOXA7P31268 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
HOXA7P31268 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
HOXA7P31268 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
HOXA7P31268 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
HOXA7P31268 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HOXA7P31268 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HOXA7P31268 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HOXA7P31268 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HOXA7P31268 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
HOXA7P31268 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HOXA7P31268 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HOXA7P31268 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HOXA7P31268 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HOXA7P31268 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HOXA7P31268 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
HOXA7P31268 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HOXA7P31268 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HOXA7P31268 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HOXA7P31268 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
HOXA7P31268 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
HOXA7P31268 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
HOXA7P31268 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
HOXA7P31268 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
HOXA7P31268 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
HOXA7P31268 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
HOXA7P31268 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
HOXA7P31268 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
HOXA7P31268 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
HOXA7P31268 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
HOXA7P31268 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
HOXA7P31268 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
HOXA7P31268 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
HOXA7P31268 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
HOXA7P31268 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
HOXA7P31268 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
HOXA7P31268 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
HOXA7P31268 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
HOXA7P31268 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
HOXA7P31268 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
HOXA7P31268 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
HOXA7P31268 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
HOXA7P31268 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
HOXA7P31268 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
HOXA7P31268 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
HOXA7P31268 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
HOXA7P31268 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
HOXA7P31268 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
HOXA7P31268 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
HOXA7P31268 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
HOXA7P31268 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HOXA7P31268 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
HOXA7P31268 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
HOXA7P31268 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
HOXA7P31268 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
HOXA7P31268 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
HOXA7P31268 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HOXA7P31268 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HOXA7P31268 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
HOXA7P31268 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HOXA7P31268 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
HOXA7P31268 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HOXA7P31268 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HOXA7P31268 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HOXA7P31268 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HOXA7P31268 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HOXA7P31268 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HOXA7P31268 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
HOXA7P31268 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
HOXA7P31268 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms