Protein–RNA interactions for Protein: P30558

F2r, Proteinase-activated receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F2rP30558 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
F2rP30558 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
F2rP30558 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
F2rP30558 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
F2rP30558 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
F2rP30558 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
F2rP30558 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
F2rP30558 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
F2rP30558 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
F2rP30558 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
F2rP30558 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
F2rP30558 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
F2rP30558 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
F2rP30558 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
F2rP30558 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
F2rP30558 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
F2rP30558 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
F2rP30558 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
F2rP30558 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
F2rP30558 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
F2rP30558 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
F2rP30558 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
F2rP30558 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
F2rP30558 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
F2rP30558 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
F2rP30558 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
F2rP30558 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
F2rP30558 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
F2rP30558 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
F2rP30558 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
F2rP30558 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
F2rP30558 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
F2rP30558 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
F2rP30558 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
F2rP30558 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
F2rP30558 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
F2rP30558 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
F2rP30558 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
F2rP30558 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
F2rP30558 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
F2rP30558 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
F2rP30558 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
F2rP30558 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
F2rP30558 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
F2rP30558 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
F2rP30558 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
F2rP30558 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
F2rP30558 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
F2rP30558 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
F2rP30558 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
F2rP30558 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
F2rP30558 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
F2rP30558 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
F2rP30558 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
F2rP30558 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
F2rP30558 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
F2rP30558 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
F2rP30558 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
F2rP30558 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
F2rP30558 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
F2rP30558 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
F2rP30558 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
F2rP30558 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
F2rP30558 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
F2rP30558 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
F2rP30558 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
F2rP30558 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
F2rP30558 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
F2rP30558 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
F2rP30558 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
F2rP30558 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
F2rP30558 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
F2rP30558 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
F2rP30558 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
F2rP30558 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
F2rP30558 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
F2rP30558 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
F2rP30558 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
F2rP30558 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
F2rP30558 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
F2rP30558 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
F2rP30558 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
F2rP30558 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
F2rP30558 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
F2rP30558 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
F2rP30558 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
F2rP30558 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
F2rP30558 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
F2rP30558 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
F2rP30558 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
F2rP30558 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
F2rP30558 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
F2rP30558 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
F2rP30558 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
F2rP30558 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
F2rP30558 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
F2rP30558 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
F2rP30558 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
F2rP30558 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
F2rP30558 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms