Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cdk4P30285 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cdk4P30285 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdk4P30285 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdk4P30285 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdk4P30285 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cdk4P30285 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdk4P30285 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cdk4P30285 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdk4P30285 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdk4P30285 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cdk4P30285 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cdk4P30285 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdk4P30285 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdk4P30285 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdk4P30285 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdk4P30285 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdk4P30285 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdk4P30285 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdk4P30285 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdk4P30285 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdk4P30285 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdk4P30285 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdk4P30285 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdk4P30285 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdk4P30285 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdk4P30285 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cdk4P30285 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cdk4P30285 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cdk4P30285 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdk4P30285 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdk4P30285 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdk4P30285 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdk4P30285 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdk4P30285 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdk4P30285 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdk4P30285 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdk4P30285 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdk4P30285 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdk4P30285 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdk4P30285 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdk4P30285 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdk4P30285 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdk4P30285 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdk4P30285 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdk4P30285 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdk4P30285 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdk4P30285 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdk4P30285 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdk4P30285 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdk4P30285 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdk4P30285 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdk4P30285 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdk4P30285 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdk4P30285 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdk4P30285 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdk4P30285 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdk4P30285 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdk4P30285 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdk4P30285 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdk4P30285 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdk4P30285 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdk4P30285 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdk4P30285 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdk4P30285 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cdk4P30285 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdk4P30285 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdk4P30285 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdk4P30285 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdk4P30285 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdk4P30285 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdk4P30285 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdk4P30285 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdk4P30285 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdk4P30285 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdk4P30285 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdk4P30285 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdk4P30285 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdk4P30285 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdk4P30285 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdk4P30285 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdk4P30285 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdk4P30285 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdk4P30285 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdk4P30285 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdk4P30285 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdk4P30285 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdk4P30285 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdk4P30285 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdk4P30285 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdk4P30285 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdk4P30285 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cdk4P30285 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdk4P30285 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdk4P30285 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdk4P30285 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdk4P30285 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdk4P30285 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdk4P30285 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdk4P30285 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms