Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VtnP29788 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VtnP29788 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VtnP29788 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VtnP29788 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VtnP29788 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VtnP29788 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VtnP29788 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VtnP29788 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VtnP29788 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VtnP29788 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VtnP29788 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VtnP29788 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VtnP29788 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VtnP29788 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VtnP29788 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VtnP29788 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VtnP29788 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VtnP29788 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VtnP29788 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VtnP29788 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VtnP29788 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VtnP29788 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VtnP29788 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
VtnP29788 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VtnP29788 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VtnP29788 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VtnP29788 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VtnP29788 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VtnP29788 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VtnP29788 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VtnP29788 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VtnP29788 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VtnP29788 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VtnP29788 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VtnP29788 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VtnP29788 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VtnP29788 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VtnP29788 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VtnP29788 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VtnP29788 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
VtnP29788 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VtnP29788 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
VtnP29788 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VtnP29788 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VtnP29788 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VtnP29788 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VtnP29788 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VtnP29788 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VtnP29788 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VtnP29788 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VtnP29788 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VtnP29788 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VtnP29788 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VtnP29788 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VtnP29788 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VtnP29788 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VtnP29788 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VtnP29788 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VtnP29788 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VtnP29788 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VtnP29788 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VtnP29788 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VtnP29788 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VtnP29788 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VtnP29788 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VtnP29788 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
VtnP29788 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VtnP29788 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VtnP29788 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VtnP29788 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VtnP29788 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VtnP29788 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VtnP29788 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VtnP29788 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VtnP29788 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VtnP29788 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VtnP29788 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VtnP29788 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VtnP29788 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VtnP29788 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VtnP29788 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VtnP29788 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VtnP29788 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VtnP29788 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VtnP29788 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VtnP29788 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VtnP29788 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VtnP29788 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VtnP29788 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VtnP29788 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VtnP29788 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VtnP29788 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VtnP29788 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VtnP29788 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VtnP29788 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VtnP29788 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VtnP29788 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VtnP29788 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VtnP29788 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms