Protein–RNA interactions for Protein: P29373

CRABP2, Cellular retinoic acid-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP2P29373 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRABP2P29373 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRABP2P29373 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CRABP2P29373 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRABP2P29373 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRABP2P29373 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRABP2P29373 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRABP2P29373 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRABP2P29373 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRABP2P29373 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRABP2P29373 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRABP2P29373 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRABP2P29373 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRABP2P29373 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRABP2P29373 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRABP2P29373 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CRABP2P29373 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRABP2P29373 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CRABP2P29373 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRABP2P29373 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRABP2P29373 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRABP2P29373 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRABP2P29373 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRABP2P29373 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRABP2P29373 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRABP2P29373 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRABP2P29373 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRABP2P29373 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRABP2P29373 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRABP2P29373 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRABP2P29373 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRABP2P29373 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRABP2P29373 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRABP2P29373 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRABP2P29373 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CRABP2P29373 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRABP2P29373 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CRABP2P29373 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRABP2P29373 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRABP2P29373 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRABP2P29373 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRABP2P29373 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRABP2P29373 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRABP2P29373 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRABP2P29373 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRABP2P29373 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRABP2P29373 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRABP2P29373 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRABP2P29373 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRABP2P29373 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRABP2P29373 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRABP2P29373 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRABP2P29373 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRABP2P29373 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRABP2P29373 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRABP2P29373 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRABP2P29373 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRABP2P29373 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRABP2P29373 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRABP2P29373 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRABP2P29373 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRABP2P29373 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CRABP2P29373 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
CRABP2P29373 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRABP2P29373 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRABP2P29373 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRABP2P29373 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRABP2P29373 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRABP2P29373 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRABP2P29373 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRABP2P29373 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRABP2P29373 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRABP2P29373 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRABP2P29373 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRABP2P29373 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRABP2P29373 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRABP2P29373 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRABP2P29373 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CRABP2P29373 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRABP2P29373 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRABP2P29373 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRABP2P29373 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRABP2P29373 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRABP2P29373 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRABP2P29373 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRABP2P29373 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRABP2P29373 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRABP2P29373 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRABP2P29373 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
CRABP2P29373 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRABP2P29373 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRABP2P29373 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRABP2P29373 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRABP2P29373 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRABP2P29373 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRABP2P29373 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRABP2P29373 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRABP2P29373 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRABP2P29373 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRABP2P29373 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms