Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gjb1P28230 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gjb1P28230 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Gjb1P28230 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gjb1P28230 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gjb1P28230 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gjb1P28230 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gjb1P28230 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Gjb1P28230 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gjb1P28230 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gjb1P28230 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gjb1P28230 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gjb1P28230 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gjb1P28230 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Gjb1P28230 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gjb1P28230 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gjb1P28230 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gjb1P28230 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gjb1P28230 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gjb1P28230 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gjb1P28230 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gjb1P28230 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gjb1P28230 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gjb1P28230 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gjb1P28230 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gjb1P28230 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gjb1P28230 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gjb1P28230 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Gjb1P28230 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gjb1P28230 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Gjb1P28230 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gjb1P28230 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gjb1P28230 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gjb1P28230 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Gjb1P28230 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gjb1P28230 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gjb1P28230 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gjb1P28230 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gjb1P28230 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gjb1P28230 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gjb1P28230 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gjb1P28230 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gjb1P28230 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gjb1P28230 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Gjb1P28230 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gjb1P28230 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gjb1P28230 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gjb1P28230 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Gjb1P28230 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gjb1P28230 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gjb1P28230 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gjb1P28230 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Gjb1P28230 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gjb1P28230 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gjb1P28230 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Gjb1P28230 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gjb1P28230 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gjb1P28230 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gjb1P28230 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gjb1P28230 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gjb1P28230 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Gjb1P28230 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gjb1P28230 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gjb1P28230 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gjb1P28230 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gjb1P28230 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gjb1P28230 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gjb1P28230 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gjb1P28230 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gjb1P28230 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gjb1P28230 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gjb1P28230 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gjb1P28230 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gjb1P28230 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gjb1P28230 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gjb1P28230 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gjb1P28230 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Gjb1P28230 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gjb1P28230 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gjb1P28230 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gjb1P28230 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gjb1P28230 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gjb1P28230 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Gjb1P28230 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gjb1P28230 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gjb1P28230 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gjb1P28230 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gjb1P28230 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gjb1P28230 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Gjb1P28230 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gjb1P28230 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gjb1P28230 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gjb1P28230 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gjb1P28230 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gjb1P28230 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gjb1P28230 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gjb1P28230 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Gjb1P28230 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gjb1P28230 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gjb1P28230 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms