Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PDE4AP27815 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
PDE4AP27815 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PDE4AP27815 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PDE4AP27815 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PDE4AP27815 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PDE4AP27815 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PDE4AP27815 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PDE4AP27815 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PDE4AP27815 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PDE4AP27815 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PDE4AP27815 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
PDE4AP27815 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
PDE4AP27815 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
PDE4AP27815 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
PDE4AP27815 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
PDE4AP27815 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PDE4AP27815 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PDE4AP27815 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PDE4AP27815 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PDE4AP27815 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PDE4AP27815 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PDE4AP27815 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PDE4AP27815 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PDE4AP27815 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PDE4AP27815 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PDE4AP27815 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PDE4AP27815 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PDE4AP27815 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PDE4AP27815 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PDE4AP27815 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PDE4AP27815 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PDE4AP27815 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PDE4AP27815 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
PDE4AP27815 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PDE4AP27815 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PDE4AP27815 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PDE4AP27815 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PDE4AP27815 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PDE4AP27815 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PDE4AP27815 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PDE4AP27815 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PDE4AP27815 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PDE4AP27815 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PDE4AP27815 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PDE4AP27815 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
PDE4AP27815 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PDE4AP27815 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PDE4AP27815 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PDE4AP27815 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PDE4AP27815 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PDE4AP27815 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PDE4AP27815 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PDE4AP27815 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PDE4AP27815 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PDE4AP27815 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PDE4AP27815 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PDE4AP27815 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PDE4AP27815 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PDE4AP27815 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PDE4AP27815 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PDE4AP27815 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PDE4AP27815 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PDE4AP27815 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PDE4AP27815 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PDE4AP27815 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PDE4AP27815 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PDE4AP27815 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PDE4AP27815 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PDE4AP27815 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PDE4AP27815 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PDE4AP27815 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PDE4AP27815 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PDE4AP27815 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PDE4AP27815 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PDE4AP27815 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PDE4AP27815 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PDE4AP27815 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PDE4AP27815 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PDE4AP27815 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
PDE4AP27815 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PDE4AP27815 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PDE4AP27815 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PDE4AP27815 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PDE4AP27815 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PDE4AP27815 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PDE4AP27815 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PDE4AP27815 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PDE4AP27815 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PDE4AP27815 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PDE4AP27815 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PDE4AP27815 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PDE4AP27815 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PDE4AP27815 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PDE4AP27815 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PDE4AP27815 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PDE4AP27815 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PDE4AP27815 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PDE4AP27815 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PDE4AP27815 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms