Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTX3P26022 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTX3P26022 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTX3P26022 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTX3P26022 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTX3P26022 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTX3P26022 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTX3P26022 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTX3P26022 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTX3P26022 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTX3P26022 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTX3P26022 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PTX3P26022 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PTX3P26022 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTX3P26022 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTX3P26022 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTX3P26022 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTX3P26022 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTX3P26022 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTX3P26022 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTX3P26022 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTX3P26022 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTX3P26022 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTX3P26022 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTX3P26022 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTX3P26022 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTX3P26022 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTX3P26022 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTX3P26022 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTX3P26022 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTX3P26022 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTX3P26022 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PTX3P26022 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTX3P26022 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTX3P26022 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTX3P26022 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTX3P26022 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PTX3P26022 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PTX3P26022 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTX3P26022 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTX3P26022 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTX3P26022 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTX3P26022 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTX3P26022 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTX3P26022 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTX3P26022 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTX3P26022 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTX3P26022 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTX3P26022 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTX3P26022 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTX3P26022 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTX3P26022 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTX3P26022 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTX3P26022 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTX3P26022 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTX3P26022 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTX3P26022 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTX3P26022 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTX3P26022 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTX3P26022 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTX3P26022 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTX3P26022 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTX3P26022 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PTX3P26022 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTX3P26022 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTX3P26022 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTX3P26022 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTX3P26022 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTX3P26022 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTX3P26022 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTX3P26022 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTX3P26022 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTX3P26022 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTX3P26022 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTX3P26022 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTX3P26022 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTX3P26022 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTX3P26022 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTX3P26022 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTX3P26022 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTX3P26022 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTX3P26022 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTX3P26022 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTX3P26022 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTX3P26022 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTX3P26022 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PTX3P26022 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTX3P26022 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTX3P26022 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTX3P26022 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTX3P26022 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTX3P26022 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PTX3P26022 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTX3P26022 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTX3P26022 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTX3P26022 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTX3P26022 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTX3P26022 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTX3P26022 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTX3P26022 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms