Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Itgb7P26011 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Itgb7P26011 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Itgb7P26011 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Itgb7P26011 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Itgb7P26011 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Itgb7P26011 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Itgb7P26011 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Itgb7P26011 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Itgb7P26011 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Itgb7P26011 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Itgb7P26011 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Itgb7P26011 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Itgb7P26011 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Itgb7P26011 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Itgb7P26011 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Itgb7P26011 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Itgb7P26011 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Itgb7P26011 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Itgb7P26011 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Itgb7P26011 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Itgb7P26011 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Itgb7P26011 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Itgb7P26011 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Itgb7P26011 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Itgb7P26011 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Itgb7P26011 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Itgb7P26011 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Itgb7P26011 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Itgb7P26011 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Itgb7P26011 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Itgb7P26011 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Itgb7P26011 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Itgb7P26011 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Itgb7P26011 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Itgb7P26011 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Itgb7P26011 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Itgb7P26011 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Itgb7P26011 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Itgb7P26011 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Itgb7P26011 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Itgb7P26011 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Itgb7P26011 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Itgb7P26011 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Itgb7P26011 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Itgb7P26011 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Itgb7P26011 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Itgb7P26011 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Itgb7P26011 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Itgb7P26011 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Itgb7P26011 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Itgb7P26011 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Itgb7P26011 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Itgb7P26011 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Itgb7P26011 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Itgb7P26011 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Itgb7P26011 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Itgb7P26011 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Itgb7P26011 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Itgb7P26011 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Itgb7P26011 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Itgb7P26011 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Itgb7P26011 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Itgb7P26011 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Itgb7P26011 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Itgb7P26011 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Itgb7P26011 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Itgb7P26011 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Itgb7P26011 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Itgb7P26011 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Itgb7P26011 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Itgb7P26011 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Itgb7P26011 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Itgb7P26011 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Itgb7P26011 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Itgb7P26011 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Itgb7P26011 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Itgb7P26011 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Itgb7P26011 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Itgb7P26011 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Itgb7P26011 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Itgb7P26011 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Itgb7P26011 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Itgb7P26011 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Itgb7P26011 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Itgb7P26011 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Itgb7P26011 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Itgb7P26011 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Itgb7P26011 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Itgb7P26011 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Itgb7P26011 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Itgb7P26011 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Itgb7P26011 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Itgb7P26011 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Itgb7P26011 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Itgb7P26011 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Itgb7P26011 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Itgb7P26011 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Itgb7P26011 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Itgb7P26011 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms