Protein–RNA interactions for Protein: P25106

ACKR3, Atypical chemokine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR3P25106 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACKR3P25106 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACKR3P25106 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACKR3P25106 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACKR3P25106 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACKR3P25106 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACKR3P25106 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACKR3P25106 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACKR3P25106 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACKR3P25106 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ACKR3P25106 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACKR3P25106 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACKR3P25106 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACKR3P25106 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACKR3P25106 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACKR3P25106 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACKR3P25106 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ACKR3P25106 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACKR3P25106 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACKR3P25106 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACKR3P25106 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACKR3P25106 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ACKR3P25106 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACKR3P25106 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACKR3P25106 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACKR3P25106 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACKR3P25106 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACKR3P25106 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACKR3P25106 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACKR3P25106 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACKR3P25106 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACKR3P25106 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACKR3P25106 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACKR3P25106 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACKR3P25106 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ACKR3P25106 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACKR3P25106 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACKR3P25106 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACKR3P25106 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACKR3P25106 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACKR3P25106 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACKR3P25106 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACKR3P25106 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACKR3P25106 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACKR3P25106 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACKR3P25106 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACKR3P25106 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACKR3P25106 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACKR3P25106 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACKR3P25106 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACKR3P25106 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACKR3P25106 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACKR3P25106 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ACKR3P25106 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACKR3P25106 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACKR3P25106 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ACKR3P25106 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACKR3P25106 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACKR3P25106 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACKR3P25106 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACKR3P25106 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACKR3P25106 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACKR3P25106 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACKR3P25106 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACKR3P25106 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACKR3P25106 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACKR3P25106 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ACKR3P25106 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACKR3P25106 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACKR3P25106 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACKR3P25106 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACKR3P25106 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACKR3P25106 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACKR3P25106 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACKR3P25106 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACKR3P25106 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACKR3P25106 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACKR3P25106 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACKR3P25106 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACKR3P25106 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACKR3P25106 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACKR3P25106 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACKR3P25106 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACKR3P25106 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACKR3P25106 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACKR3P25106 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACKR3P25106 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACKR3P25106 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACKR3P25106 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACKR3P25106 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACKR3P25106 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACKR3P25106 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACKR3P25106 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACKR3P25106 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACKR3P25106 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACKR3P25106 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACKR3P25106 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACKR3P25106 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACKR3P25106 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACKR3P25106 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms