Protein–RNA interactions for Protein: P24386

CHM, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP24386 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP24386 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP24386 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP24386 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP24386 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP24386 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP24386 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP24386 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP24386 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP24386 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP24386 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP24386 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP24386 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP24386 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP24386 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP24386 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP24386 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP24386 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP24386 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP24386 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP24386 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP24386 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP24386 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP24386 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP24386 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP24386 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP24386 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP24386 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP24386 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP24386 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP24386 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP24386 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP24386 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP24386 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP24386 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP24386 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP24386 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP24386 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP24386 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP24386 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP24386 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP24386 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP24386 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP24386 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP24386 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP24386 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP24386 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP24386 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP24386 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP24386 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP24386 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP24386 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP24386 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP24386 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP24386 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP24386 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP24386 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP24386 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP24386 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP24386 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP24386 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP24386 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP24386 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP24386 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP24386 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP24386 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP24386 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP24386 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP24386 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP24386 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP24386 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP24386 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP24386 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP24386 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP24386 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP24386 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP24386 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP24386 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP24386 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP24386 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP24386 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP24386 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP24386 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP24386 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP24386 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP24386 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP24386 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP24386 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP24386 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHMP24386 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP24386 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP24386 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP24386 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP24386 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP24386 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP24386 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP24386 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP24386 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP24386 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP24386 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms