Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPH2P23942 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPH2P23942 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPH2P23942 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPH2P23942 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPH2P23942 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPH2P23942 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPH2P23942 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPH2P23942 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPH2P23942 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPH2P23942 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPH2P23942 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPH2P23942 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPH2P23942 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPH2P23942 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPH2P23942 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPH2P23942 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPH2P23942 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPH2P23942 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPH2P23942 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPH2P23942 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPH2P23942 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPH2P23942 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPH2P23942 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPH2P23942 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPH2P23942 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPH2P23942 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPH2P23942 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPH2P23942 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPH2P23942 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPH2P23942 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPH2P23942 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPH2P23942 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPH2P23942 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPH2P23942 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPH2P23942 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPH2P23942 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPH2P23942 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPH2P23942 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPH2P23942 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPH2P23942 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPH2P23942 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPH2P23942 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPH2P23942 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPH2P23942 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPH2P23942 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPH2P23942 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPH2P23942 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPH2P23942 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPH2P23942 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPH2P23942 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPH2P23942 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPH2P23942 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPH2P23942 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPH2P23942 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPH2P23942 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPH2P23942 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPH2P23942 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPH2P23942 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPH2P23942 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPH2P23942 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPH2P23942 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPH2P23942 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPH2P23942 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPH2P23942 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPH2P23942 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPH2P23942 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPH2P23942 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPH2P23942 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRPH2P23942 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRPH2P23942 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPH2P23942 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPH2P23942 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPH2P23942 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPH2P23942 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPH2P23942 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPH2P23942 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPH2P23942 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPH2P23942 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPH2P23942 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPH2P23942 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPH2P23942 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPH2P23942 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPH2P23942 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPH2P23942 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPH2P23942 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPH2P23942 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPH2P23942 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPH2P23942 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPH2P23942 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPH2P23942 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPH2P23942 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPH2P23942 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPH2P23942 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPH2P23942 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRPH2P23942 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPH2P23942 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPH2P23942 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPH2P23942 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPH2P23942 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms