Protein–RNA interactions for Protein: P22907

Hmbs, Porphobilinogen deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmbsP22907 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HmbsP22907 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HmbsP22907 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HmbsP22907 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HmbsP22907 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HmbsP22907 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HmbsP22907 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HmbsP22907 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HmbsP22907 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HmbsP22907 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HmbsP22907 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HmbsP22907 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HmbsP22907 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HmbsP22907 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HmbsP22907 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HmbsP22907 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HmbsP22907 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HmbsP22907 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HmbsP22907 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HmbsP22907 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HmbsP22907 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HmbsP22907 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HmbsP22907 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HmbsP22907 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HmbsP22907 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HmbsP22907 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HmbsP22907 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HmbsP22907 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HmbsP22907 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HmbsP22907 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HmbsP22907 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HmbsP22907 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HmbsP22907 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HmbsP22907 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HmbsP22907 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HmbsP22907 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HmbsP22907 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HmbsP22907 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HmbsP22907 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HmbsP22907 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HmbsP22907 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HmbsP22907 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HmbsP22907 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HmbsP22907 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HmbsP22907 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HmbsP22907 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HmbsP22907 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HmbsP22907 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HmbsP22907 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HmbsP22907 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HmbsP22907 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HmbsP22907 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HmbsP22907 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HmbsP22907 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HmbsP22907 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HmbsP22907 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HmbsP22907 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HmbsP22907 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HmbsP22907 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HmbsP22907 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HmbsP22907 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HmbsP22907 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HmbsP22907 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HmbsP22907 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HmbsP22907 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HmbsP22907 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HmbsP22907 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HmbsP22907 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HmbsP22907 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HmbsP22907 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HmbsP22907 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HmbsP22907 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HmbsP22907 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HmbsP22907 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HmbsP22907 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HmbsP22907 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HmbsP22907 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HmbsP22907 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HmbsP22907 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HmbsP22907 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HmbsP22907 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HmbsP22907 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HmbsP22907 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HmbsP22907 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HmbsP22907 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HmbsP22907 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HmbsP22907 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HmbsP22907 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HmbsP22907 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HmbsP22907 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HmbsP22907 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HmbsP22907 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HmbsP22907 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HmbsP22907 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HmbsP22907 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HmbsP22907 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HmbsP22907 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HmbsP22907 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HmbsP22907 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HmbsP22907 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms