Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CA4P22748 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CA4P22748 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CA4P22748 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CA4P22748 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CA4P22748 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CA4P22748 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CA4P22748 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CA4P22748 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CA4P22748 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CA4P22748 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CA4P22748 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CA4P22748 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CA4P22748 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CA4P22748 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CA4P22748 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CA4P22748 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CA4P22748 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CA4P22748 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CA4P22748 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CA4P22748 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CA4P22748 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CA4P22748 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CA4P22748 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CA4P22748 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CA4P22748 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CA4P22748 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CA4P22748 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CA4P22748 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CA4P22748 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CA4P22748 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CA4P22748 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CA4P22748 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CA4P22748 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CA4P22748 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CA4P22748 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CA4P22748 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CA4P22748 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CA4P22748 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CA4P22748 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CA4P22748 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CA4P22748 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CA4P22748 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CA4P22748 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CA4P22748 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CA4P22748 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CA4P22748 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CA4P22748 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CA4P22748 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CA4P22748 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CA4P22748 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CA4P22748 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CA4P22748 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CA4P22748 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CA4P22748 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CA4P22748 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CA4P22748 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CA4P22748 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CA4P22748 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CA4P22748 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CA4P22748 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CA4P22748 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CA4P22748 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CA4P22748 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CA4P22748 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CA4P22748 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CA4P22748 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CA4P22748 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CA4P22748 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CA4P22748 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CA4P22748 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CA4P22748 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CA4P22748 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CA4P22748 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CA4P22748 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CA4P22748 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CA4P22748 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CA4P22748 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CA4P22748 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CA4P22748 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CA4P22748 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CA4P22748 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CA4P22748 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CA4P22748 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CA4P22748 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CA4P22748 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CA4P22748 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CA4P22748 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CA4P22748 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CA4P22748 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CA4P22748 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CA4P22748 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CA4P22748 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CA4P22748 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CA4P22748 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CA4P22748 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CA4P22748 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CA4P22748 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CA4P22748 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CA4P22748 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms