Protein–RNA interactions for Protein: P22362

CCL1, C-C motif chemokine 1, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL1P22362 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL1P22362 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL1P22362 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL1P22362 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL1P22362 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL1P22362 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL1P22362 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL1P22362 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL1P22362 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL1P22362 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL1P22362 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL1P22362 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL1P22362 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL1P22362 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL1P22362 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL1P22362 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL1P22362 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL1P22362 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL1P22362 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL1P22362 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL1P22362 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL1P22362 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL1P22362 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL1P22362 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL1P22362 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL1P22362 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL1P22362 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL1P22362 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL1P22362 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL1P22362 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL1P22362 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL1P22362 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL1P22362 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL1P22362 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL1P22362 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL1P22362 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL1P22362 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL1P22362 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL1P22362 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL1P22362 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL1P22362 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL1P22362 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL1P22362 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL1P22362 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL1P22362 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL1P22362 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL1P22362 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL1P22362 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL1P22362 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL1P22362 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL1P22362 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL1P22362 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL1P22362 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL1P22362 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL1P22362 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL1P22362 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL1P22362 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL1P22362 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL1P22362 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL1P22362 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL1P22362 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL1P22362 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL1P22362 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL1P22362 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL1P22362 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCL1P22362 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCL1P22362 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCL1P22362 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCL1P22362 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCL1P22362 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL1P22362 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL1P22362 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL1P22362 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL1P22362 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL1P22362 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL1P22362 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL1P22362 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL1P22362 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL1P22362 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL1P22362 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL1P22362 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL1P22362 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCL1P22362 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCL1P22362 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCL1P22362 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCL1P22362 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCL1P22362 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCL1P22362 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL1P22362 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL1P22362 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL1P22362 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL1P22362 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL1P22362 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL1P22362 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL1P22362 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL1P22362 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL1P22362 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL1P22362 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL1P22362 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL1P22362 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms