Protein–RNA interactions for Protein: P22223

CDH3, Cadherin-3, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH3P22223 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDH3P22223 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDH3P22223 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDH3P22223 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH3P22223 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH3P22223 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH3P22223 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH3P22223 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH3P22223 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH3P22223 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH3P22223 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH3P22223 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH3P22223 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH3P22223 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH3P22223 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDH3P22223 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDH3P22223 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH3P22223 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH3P22223 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDH3P22223 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDH3P22223 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDH3P22223 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDH3P22223 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDH3P22223 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDH3P22223 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH3P22223 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH3P22223 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH3P22223 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH3P22223 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH3P22223 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH3P22223 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH3P22223 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH3P22223 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH3P22223 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH3P22223 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH3P22223 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH3P22223 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH3P22223 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH3P22223 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH3P22223 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH3P22223 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH3P22223 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH3P22223 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH3P22223 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH3P22223 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH3P22223 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH3P22223 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH3P22223 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH3P22223 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH3P22223 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH3P22223 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH3P22223 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH3P22223 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH3P22223 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH3P22223 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH3P22223 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH3P22223 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH3P22223 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH3P22223 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CDH3P22223 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDH3P22223 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDH3P22223 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH3P22223 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH3P22223 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH3P22223 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH3P22223 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH3P22223 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH3P22223 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH3P22223 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH3P22223 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH3P22223 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH3P22223 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH3P22223 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH3P22223 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH3P22223 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH3P22223 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH3P22223 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH3P22223 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH3P22223 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH3P22223 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH3P22223 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH3P22223 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDH3P22223 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDH3P22223 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH3P22223 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH3P22223 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH3P22223 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH3P22223 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH3P22223 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH3P22223 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH3P22223 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH3P22223 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH3P22223 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH3P22223 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH3P22223 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH3P22223 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH3P22223 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH3P22223 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH3P22223 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH3P22223 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms