Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pou3f1P21952 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pou3f1P21952 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pou3f1P21952 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pou3f1P21952 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pou3f1P21952 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pou3f1P21952 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pou3f1P21952 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pou3f1P21952 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pou3f1P21952 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pou3f1P21952 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pou3f1P21952 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pou3f1P21952 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pou3f1P21952 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pou3f1P21952 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Pou3f1P21952 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pou3f1P21952 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pou3f1P21952 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pou3f1P21952 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pou3f1P21952 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pou3f1P21952 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pou3f1P21952 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pou3f1P21952 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pou3f1P21952 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Pou3f1P21952 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pou3f1P21952 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pou3f1P21952 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pou3f1P21952 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pou3f1P21952 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pou3f1P21952 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pou3f1P21952 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pou3f1P21952 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pou3f1P21952 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pou3f1P21952 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pou3f1P21952 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pou3f1P21952 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pou3f1P21952 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pou3f1P21952 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pou3f1P21952 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pou3f1P21952 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pou3f1P21952 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pou3f1P21952 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pou3f1P21952 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pou3f1P21952 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pou3f1P21952 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pou3f1P21952 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pou3f1P21952 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pou3f1P21952 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pou3f1P21952 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pou3f1P21952 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pou3f1P21952 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pou3f1P21952 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pou3f1P21952 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Pou3f1P21952 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pou3f1P21952 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pou3f1P21952 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pou3f1P21952 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pou3f1P21952 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pou3f1P21952 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pou3f1P21952 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pou3f1P21952 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pou3f1P21952 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pou3f1P21952 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pou3f1P21952 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pou3f1P21952 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pou3f1P21952 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pou3f1P21952 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pou3f1P21952 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pou3f1P21952 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pou3f1P21952 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pou3f1P21952 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pou3f1P21952 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Pou3f1P21952 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pou3f1P21952 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pou3f1P21952 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pou3f1P21952 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pou3f1P21952 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pou3f1P21952 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pou3f1P21952 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pou3f1P21952 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pou3f1P21952 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pou3f1P21952 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pou3f1P21952 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pou3f1P21952 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pou3f1P21952 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pou3f1P21952 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pou3f1P21952 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pou3f1P21952 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pou3f1P21952 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pou3f1P21952 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pou3f1P21952 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pou3f1P21952 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pou3f1P21952 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pou3f1P21952 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pou3f1P21952 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pou3f1P21952 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pou3f1P21952 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pou3f1P21952 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pou3f1P21952 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pou3f1P21952 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms