Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHA1P21709 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHA1P21709 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EPHA1P21709 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPHA1P21709 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPHA1P21709 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPHA1P21709 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPHA1P21709 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPHA1P21709 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPHA1P21709 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPHA1P21709 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPHA1P21709 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EPHA1P21709 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPHA1P21709 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPHA1P21709 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPHA1P21709 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHA1P21709 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHA1P21709 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHA1P21709 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHA1P21709 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHA1P21709 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPHA1P21709 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPHA1P21709 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPHA1P21709 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EPHA1P21709 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EPHA1P21709 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EPHA1P21709 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EPHA1P21709 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
EPHA1P21709 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EPHA1P21709 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EPHA1P21709 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EPHA1P21709 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EPHA1P21709 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EPHA1P21709 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
EPHA1P21709 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EPHA1P21709 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EPHA1P21709 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EPHA1P21709 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EPHA1P21709 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EPHA1P21709 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EPHA1P21709 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EPHA1P21709 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EPHA1P21709 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EPHA1P21709 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EPHA1P21709 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
EPHA1P21709 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
EPHA1P21709 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EPHA1P21709 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EPHA1P21709 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EPHA1P21709 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EPHA1P21709 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EPHA1P21709 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EPHA1P21709 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EPHA1P21709 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EPHA1P21709 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHA1P21709 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHA1P21709 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHA1P21709 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHA1P21709 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHA1P21709 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHA1P21709 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHA1P21709 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHA1P21709 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPHA1P21709 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPHA1P21709 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPHA1P21709 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPHA1P21709 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPHA1P21709 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPHA1P21709 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPHA1P21709 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EPHA1P21709 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EPHA1P21709 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EPHA1P21709 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EPHA1P21709 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EPHA1P21709 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EPHA1P21709 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EPHA1P21709 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
EPHA1P21709 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPHA1P21709 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPHA1P21709 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPHA1P21709 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EPHA1P21709 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPHA1P21709 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EPHA1P21709 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPHA1P21709 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPHA1P21709 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPHA1P21709 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPHA1P21709 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPHA1P21709 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPHA1P21709 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPHA1P21709 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPHA1P21709 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPHA1P21709 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPHA1P21709 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPHA1P21709 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPHA1P21709 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPHA1P21709 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPHA1P21709 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPHA1P21709 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPHA1P21709 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms