Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TAF1P21675 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TAF1P21675 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TAF1P21675 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TAF1P21675 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TAF1P21675 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TAF1P21675 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TAF1P21675 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TAF1P21675 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
TAF1P21675 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TAF1P21675 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TAF1P21675 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TAF1P21675 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TAF1P21675 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TAF1P21675 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TAF1P21675 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TAF1P21675 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TAF1P21675 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TAF1P21675 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TAF1P21675 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TAF1P21675 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TAF1P21675 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TAF1P21675 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TAF1P21675 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TAF1P21675 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TAF1P21675 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TAF1P21675 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TAF1P21675 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TAF1P21675 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TAF1P21675 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TAF1P21675 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TAF1P21675 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TAF1P21675 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TAF1P21675 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TAF1P21675 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TAF1P21675 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TAF1P21675 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TAF1P21675 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TAF1P21675 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TAF1P21675 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TAF1P21675 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TAF1P21675 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TAF1P21675 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TAF1P21675 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TAF1P21675 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TAF1P21675 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TAF1P21675 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TAF1P21675 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TAF1P21675 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TAF1P21675 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TAF1P21675 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TAF1P21675 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TAF1P21675 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TAF1P21675 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TAF1P21675 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TAF1P21675 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TAF1P21675 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TAF1P21675 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
TAF1P21675 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
TAF1P21675 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TAF1P21675 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TAF1P21675 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TAF1P21675 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TAF1P21675 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TAF1P21675 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
TAF1P21675 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TAF1P21675 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TAF1P21675 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TAF1P21675 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TAF1P21675 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TAF1P21675 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
TAF1P21675 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TAF1P21675 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TAF1P21675 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TAF1P21675 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TAF1P21675 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
TAF1P21675 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
TAF1P21675 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TAF1P21675 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TAF1P21675 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TAF1P21675 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
TAF1P21675 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TAF1P21675 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TAF1P21675 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TAF1P21675 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
TAF1P21675 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TAF1P21675 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TAF1P21675 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TAF1P21675 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TAF1P21675 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TAF1P21675 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TAF1P21675 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TAF1P21675 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
TAF1P21675 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TAF1P21675 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TAF1P21675 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TAF1P21675 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TAF1P21675 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TAF1P21675 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TAF1P21675 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms