Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SYT1P21579 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SYT1P21579 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYT1P21579 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYT1P21579 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYT1P21579 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYT1P21579 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYT1P21579 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYT1P21579 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SYT1P21579 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SYT1P21579 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SYT1P21579 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
SYT1P21579 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SYT1P21579 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SYT1P21579 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYT1P21579 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYT1P21579 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYT1P21579 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYT1P21579 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SYT1P21579 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SYT1P21579 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SYT1P21579 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SYT1P21579 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SYT1P21579 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SYT1P21579 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SYT1P21579 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SYT1P21579 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYT1P21579 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYT1P21579 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
SYT1P21579 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
SYT1P21579 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SYT1P21579 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SYT1P21579 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SYT1P21579 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SYT1P21579 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SYT1P21579 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SYT1P21579 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SYT1P21579 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYT1P21579 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYT1P21579 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYT1P21579 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
SYT1P21579 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYT1P21579 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYT1P21579 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SYT1P21579 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SYT1P21579 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
SYT1P21579 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SYT1P21579 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SYT1P21579 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SYT1P21579 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SYT1P21579 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SYT1P21579 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYT1P21579 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYT1P21579 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYT1P21579 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYT1P21579 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYT1P21579 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYT1P21579 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYT1P21579 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYT1P21579 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYT1P21579 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYT1P21579 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYT1P21579 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYT1P21579 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYT1P21579 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SYT1P21579 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SYT1P21579 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SYT1P21579 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SYT1P21579 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SYT1P21579 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SYT1P21579 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYT1P21579 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYT1P21579 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYT1P21579 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SYT1P21579 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SYT1P21579 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SYT1P21579 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SYT1P21579 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SYT1P21579 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYT1P21579 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SYT1P21579 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SYT1P21579 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SYT1P21579 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYT1P21579 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SYT1P21579 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SYT1P21579 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SYT1P21579 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SYT1P21579 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SYT1P21579 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SYT1P21579 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SYT1P21579 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SYT1P21579 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SYT1P21579 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SYT1P21579 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SYT1P21579 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SYT1P21579 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SYT1P21579 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SYT1P21579 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYT1P21579 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYT1P21579 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms