Protein–RNA interactions for Protein: P21440

Abcb4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb4P21440 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcb4P21440 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcb4P21440 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcb4P21440 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Abcb4P21440 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Abcb4P21440 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Abcb4P21440 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Abcb4P21440 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Abcb4P21440 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Abcb4P21440 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Abcb4P21440 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Abcb4P21440 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Abcb4P21440 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Abcb4P21440 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Abcb4P21440 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Abcb4P21440 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Abcb4P21440 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Abcb4P21440 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Abcb4P21440 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Abcb4P21440 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Abcb4P21440 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Abcb4P21440 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Abcb4P21440 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Abcb4P21440 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Abcb4P21440 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Abcb4P21440 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Abcb4P21440 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Abcb4P21440 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Abcb4P21440 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Abcb4P21440 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Abcb4P21440 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Abcb4P21440 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Abcb4P21440 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Abcb4P21440 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Abcb4P21440 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Abcb4P21440 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Abcb4P21440 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Abcb4P21440 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Abcb4P21440 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcb4P21440 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcb4P21440 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcb4P21440 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcb4P21440 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcb4P21440 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcb4P21440 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcb4P21440 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Abcb4P21440 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Abcb4P21440 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Abcb4P21440 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Abcb4P21440 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Abcb4P21440 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Abcb4P21440 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Abcb4P21440 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Abcb4P21440 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Abcb4P21440 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Abcb4P21440 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Abcb4P21440 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Abcb4P21440 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Abcb4P21440 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Abcb4P21440 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Abcb4P21440 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Abcb4P21440 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Abcb4P21440 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Abcb4P21440 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcb4P21440 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcb4P21440 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcb4P21440 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcb4P21440 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcb4P21440 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcb4P21440 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcb4P21440 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcb4P21440 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcb4P21440 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcb4P21440 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcb4P21440 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcb4P21440 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcb4P21440 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcb4P21440 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Abcb4P21440 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Abcb4P21440 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Abcb4P21440 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Abcb4P21440 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Abcb4P21440 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Abcb4P21440 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Abcb4P21440 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Abcb4P21440 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Abcb4P21440 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Abcb4P21440 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Abcb4P21440 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Abcb4P21440 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Abcb4P21440 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Abcb4P21440 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Abcb4P21440 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Abcb4P21440 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Abcb4P21440 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Abcb4P21440 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Abcb4P21440 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Abcb4P21440 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Abcb4P21440 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Abcb4P21440 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms