Protein–RNA interactions for Protein: P21439

ABCB4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB4P21439 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ABCB4P21439 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCB4P21439 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCB4P21439 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCB4P21439 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCB4P21439 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCB4P21439 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCB4P21439 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCB4P21439 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCB4P21439 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCB4P21439 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCB4P21439 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCB4P21439 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCB4P21439 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCB4P21439 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCB4P21439 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCB4P21439 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCB4P21439 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCB4P21439 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCB4P21439 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCB4P21439 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCB4P21439 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCB4P21439 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCB4P21439 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCB4P21439 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCB4P21439 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ABCB4P21439 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCB4P21439 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCB4P21439 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCB4P21439 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCB4P21439 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCB4P21439 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCB4P21439 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCB4P21439 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCB4P21439 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCB4P21439 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCB4P21439 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCB4P21439 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCB4P21439 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCB4P21439 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCB4P21439 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCB4P21439 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCB4P21439 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCB4P21439 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCB4P21439 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCB4P21439 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCB4P21439 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCB4P21439 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCB4P21439 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCB4P21439 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCB4P21439 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCB4P21439 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCB4P21439 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCB4P21439 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCB4P21439 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCB4P21439 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCB4P21439 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCB4P21439 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCB4P21439 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCB4P21439 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCB4P21439 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ABCB4P21439 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCB4P21439 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCB4P21439 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCB4P21439 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCB4P21439 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.51■■■□□ 2
ABCB4P21439 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ABCB4P21439 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCB4P21439 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCB4P21439 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCB4P21439 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCB4P21439 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCB4P21439 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCB4P21439 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCB4P21439 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCB4P21439 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCB4P21439 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCB4P21439 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCB4P21439 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCB4P21439 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCB4P21439 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCB4P21439 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCB4P21439 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCB4P21439 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCB4P21439 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCB4P21439 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCB4P21439 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCB4P21439 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCB4P21439 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCB4P21439 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCB4P21439 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCB4P21439 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCB4P21439 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCB4P21439 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCB4P21439 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCB4P21439 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCB4P21439 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCB4P21439 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCB4P21439 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCB4P21439 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms