Protein–RNA interactions for Protein: P21283

ATP6V1C1, V-type proton ATPase subunit C 1, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1C1P21283 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP6V1C1P21283 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP6V1C1P21283 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP6V1C1P21283 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP6V1C1P21283 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP6V1C1P21283 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP6V1C1P21283 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP6V1C1P21283 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP6V1C1P21283 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP6V1C1P21283 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP6V1C1P21283 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP6V1C1P21283 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP6V1C1P21283 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP6V1C1P21283 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP6V1C1P21283 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP6V1C1P21283 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP6V1C1P21283 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP6V1C1P21283 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP6V1C1P21283 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP6V1C1P21283 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP6V1C1P21283 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP6V1C1P21283 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP6V1C1P21283 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP6V1C1P21283 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP6V1C1P21283 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATP6V1C1P21283 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP6V1C1P21283 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP6V1C1P21283 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP6V1C1P21283 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP6V1C1P21283 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP6V1C1P21283 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP6V1C1P21283 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP6V1C1P21283 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP6V1C1P21283 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP6V1C1P21283 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP6V1C1P21283 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP6V1C1P21283 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP6V1C1P21283 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP6V1C1P21283 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP6V1C1P21283 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP6V1C1P21283 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP6V1C1P21283 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP6V1C1P21283 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP6V1C1P21283 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP6V1C1P21283 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP6V1C1P21283 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP6V1C1P21283 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP6V1C1P21283 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP6V1C1P21283 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP6V1C1P21283 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP6V1C1P21283 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP6V1C1P21283 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP6V1C1P21283 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP6V1C1P21283 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP6V1C1P21283 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP6V1C1P21283 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP6V1C1P21283 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP6V1C1P21283 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP6V1C1P21283 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP6V1C1P21283 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP6V1C1P21283 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP6V1C1P21283 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP6V1C1P21283 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP6V1C1P21283 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP6V1C1P21283 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP6V1C1P21283 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP6V1C1P21283 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP6V1C1P21283 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP6V1C1P21283 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP6V1C1P21283 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP6V1C1P21283 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP6V1C1P21283 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP6V1C1P21283 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP6V1C1P21283 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP6V1C1P21283 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP6V1C1P21283 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP6V1C1P21283 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP6V1C1P21283 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP6V1C1P21283 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP6V1C1P21283 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP6V1C1P21283 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP6V1C1P21283 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP6V1C1P21283 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP6V1C1P21283 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP6V1C1P21283 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATP6V1C1P21283 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP6V1C1P21283 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP6V1C1P21283 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP6V1C1P21283 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP6V1C1P21283 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP6V1C1P21283 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP6V1C1P21283 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP6V1C1P21283 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP6V1C1P21283 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP6V1C1P21283 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP6V1C1P21283 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP6V1C1P21283 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP6V1C1P21283 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP6V1C1P21283 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP6V1C1P21283 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms