Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PDCP20941 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
PDCP20941 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PDCP20941 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PDCP20941 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PDCP20941 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PDCP20941 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PDCP20941 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PDCP20941 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PDCP20941 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PDCP20941 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PDCP20941 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PDCP20941 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PDCP20941 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PDCP20941 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PDCP20941 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PDCP20941 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PDCP20941 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PDCP20941 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PDCP20941 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PDCP20941 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PDCP20941 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PDCP20941 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PDCP20941 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
PDCP20941 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PDCP20941 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PDCP20941 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PDCP20941 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PDCP20941 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PDCP20941 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PDCP20941 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PDCP20941 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PDCP20941 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PDCP20941 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PDCP20941 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PDCP20941 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PDCP20941 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PDCP20941 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PDCP20941 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PDCP20941 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PDCP20941 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PDCP20941 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PDCP20941 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PDCP20941 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PDCP20941 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PDCP20941 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PDCP20941 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PDCP20941 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PDCP20941 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PDCP20941 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PDCP20941 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PDCP20941 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PDCP20941 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PDCP20941 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PDCP20941 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PDCP20941 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PDCP20941 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PDCP20941 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PDCP20941 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PDCP20941 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PDCP20941 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PDCP20941 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PDCP20941 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDCP20941 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDCP20941 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDCP20941 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDCP20941 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PDCP20941 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PDCP20941 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PDCP20941 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PDCP20941 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PDCP20941 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDCP20941 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDCP20941 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDCP20941 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDCP20941 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDCP20941 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PDCP20941 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PDCP20941 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PDCP20941 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PDCP20941 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PDCP20941 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PDCP20941 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PDCP20941 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDCP20941 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDCP20941 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDCP20941 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDCP20941 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDCP20941 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
PDCP20941 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PDCP20941 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PDCP20941 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PDCP20941 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PDCP20941 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PDCP20941 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PDCP20941 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PDCP20941 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PDCP20941 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PDCP20941 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PDCP20941 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 226 ms