Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C4BPBP20851 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4BPBP20851 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4BPBP20851 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4BPBP20851 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4BPBP20851 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4BPBP20851 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4BPBP20851 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4BPBP20851 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C4BPBP20851 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C4BPBP20851 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C4BPBP20851 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C4BPBP20851 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C4BPBP20851 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BPBP20851 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BPBP20851 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BPBP20851 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BPBP20851 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BPBP20851 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4BPBP20851 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4BPBP20851 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C4BPBP20851 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C4BPBP20851 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C4BPBP20851 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C4BPBP20851 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
C4BPBP20851 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4BPBP20851 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4BPBP20851 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4BPBP20851 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4BPBP20851 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4BPBP20851 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4BPBP20851 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4BPBP20851 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4BPBP20851 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
C4BPBP20851 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4BPBP20851 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4BPBP20851 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4BPBP20851 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4BPBP20851 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C4BPBP20851 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C4BPBP20851 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C4BPBP20851 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C4BPBP20851 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C4BPBP20851 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C4BPBP20851 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C4BPBP20851 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C4BPBP20851 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C4BPBP20851 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
C4BPBP20851 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C4BPBP20851 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C4BPBP20851 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C4BPBP20851 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C4BPBP20851 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C4BPBP20851 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C4BPBP20851 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C4BPBP20851 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C4BPBP20851 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C4BPBP20851 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C4BPBP20851 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C4BPBP20851 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C4BPBP20851 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C4BPBP20851 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C4BPBP20851 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C4BPBP20851 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C4BPBP20851 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C4BPBP20851 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C4BPBP20851 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C4BPBP20851 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C4BPBP20851 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C4BPBP20851 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C4BPBP20851 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C4BPBP20851 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C4BPBP20851 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4BPBP20851 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4BPBP20851 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4BPBP20851 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4BPBP20851 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C4BPBP20851 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C4BPBP20851 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C4BPBP20851 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4BPBP20851 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4BPBP20851 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4BPBP20851 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C4BPBP20851 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C4BPBP20851 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C4BPBP20851 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
C4BPBP20851 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
C4BPBP20851 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
C4BPBP20851 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C4BPBP20851 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4BPBP20851 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4BPBP20851 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
C4BPBP20851 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4BPBP20851 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C4BPBP20851 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C4BPBP20851 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C4BPBP20851 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C4BPBP20851 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C4BPBP20851 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4BPBP20851 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms