Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EFNA1P20827 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EFNA1P20827 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EFNA1P20827 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EFNA1P20827 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EFNA1P20827 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EFNA1P20827 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
EFNA1P20827 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EFNA1P20827 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EFNA1P20827 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EFNA1P20827 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EFNA1P20827 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EFNA1P20827 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EFNA1P20827 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFNA1P20827 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
EFNA1P20827 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
EFNA1P20827 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFNA1P20827 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EFNA1P20827 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EFNA1P20827 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EFNA1P20827 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EFNA1P20827 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EFNA1P20827 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EFNA1P20827 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EFNA1P20827 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EFNA1P20827 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EFNA1P20827 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EFNA1P20827 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EFNA1P20827 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EFNA1P20827 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFNA1P20827 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFNA1P20827 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFNA1P20827 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFNA1P20827 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFNA1P20827 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EFNA1P20827 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFNA1P20827 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFNA1P20827 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFNA1P20827 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFNA1P20827 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EFNA1P20827 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EFNA1P20827 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EFNA1P20827 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EFNA1P20827 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EFNA1P20827 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EFNA1P20827 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFNA1P20827 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFNA1P20827 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFNA1P20827 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFNA1P20827 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFNA1P20827 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFNA1P20827 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFNA1P20827 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFNA1P20827 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFNA1P20827 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFNA1P20827 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFNA1P20827 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFNA1P20827 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFNA1P20827 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFNA1P20827 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFNA1P20827 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFNA1P20827 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFNA1P20827 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFNA1P20827 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFNA1P20827 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFNA1P20827 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFNA1P20827 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFNA1P20827 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFNA1P20827 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFNA1P20827 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFNA1P20827 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFNA1P20827 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EFNA1P20827 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFNA1P20827 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFNA1P20827 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFNA1P20827 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EFNA1P20827 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EFNA1P20827 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EFNA1P20827 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EFNA1P20827 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EFNA1P20827 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EFNA1P20827 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EFNA1P20827 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EFNA1P20827 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EFNA1P20827 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EFNA1P20827 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EFNA1P20827 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EFNA1P20827 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EFNA1P20827 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EFNA1P20827 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EFNA1P20827 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EFNA1P20827 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EFNA1P20827 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EFNA1P20827 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFNA1P20827 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFNA1P20827 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EFNA1P20827 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EFNA1P20827 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EFNA1P20827 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EFNA1P20827 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms