Protein–RNA interactions for Protein: P20826

Kitlg, Kit ligand, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KitlgP20826 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KitlgP20826 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KitlgP20826 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KitlgP20826 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KitlgP20826 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KitlgP20826 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KitlgP20826 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KitlgP20826 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KitlgP20826 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KitlgP20826 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KitlgP20826 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KitlgP20826 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
KitlgP20826 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KitlgP20826 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KitlgP20826 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KitlgP20826 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KitlgP20826 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KitlgP20826 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KitlgP20826 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KitlgP20826 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KitlgP20826 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KitlgP20826 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KitlgP20826 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KitlgP20826 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KitlgP20826 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KitlgP20826 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KitlgP20826 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KitlgP20826 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KitlgP20826 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KitlgP20826 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KitlgP20826 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KitlgP20826 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KitlgP20826 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KitlgP20826 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KitlgP20826 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KitlgP20826 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KitlgP20826 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KitlgP20826 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KitlgP20826 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KitlgP20826 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KitlgP20826 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KitlgP20826 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KitlgP20826 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KitlgP20826 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KitlgP20826 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KitlgP20826 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KitlgP20826 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KitlgP20826 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KitlgP20826 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KitlgP20826 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KitlgP20826 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KitlgP20826 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KitlgP20826 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KitlgP20826 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KitlgP20826 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KitlgP20826 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KitlgP20826 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KitlgP20826 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KitlgP20826 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KitlgP20826 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KitlgP20826 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KitlgP20826 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KitlgP20826 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KitlgP20826 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KitlgP20826 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KitlgP20826 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KitlgP20826 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KitlgP20826 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KitlgP20826 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KitlgP20826 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KitlgP20826 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
KitlgP20826 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KitlgP20826 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KitlgP20826 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KitlgP20826 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KitlgP20826 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
KitlgP20826 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KitlgP20826 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
KitlgP20826 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KitlgP20826 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KitlgP20826 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KitlgP20826 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KitlgP20826 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KitlgP20826 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KitlgP20826 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KitlgP20826 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KitlgP20826 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KitlgP20826 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KitlgP20826 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
KitlgP20826 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
KitlgP20826 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KitlgP20826 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KitlgP20826 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KitlgP20826 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KitlgP20826 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KitlgP20826 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KitlgP20826 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KitlgP20826 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KitlgP20826 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KitlgP20826 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms