Protein–RNA interactions for Protein: P20138

CD33, Myeloid cell surface antigen CD33, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD33P20138 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD33P20138 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD33P20138 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD33P20138 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD33P20138 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD33P20138 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD33P20138 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD33P20138 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD33P20138 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CD33P20138 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD33P20138 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD33P20138 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD33P20138 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD33P20138 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD33P20138 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD33P20138 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD33P20138 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD33P20138 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD33P20138 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CD33P20138 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD33P20138 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD33P20138 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD33P20138 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD33P20138 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD33P20138 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD33P20138 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD33P20138 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD33P20138 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD33P20138 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CD33P20138 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CD33P20138 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CD33P20138 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD33P20138 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD33P20138 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD33P20138 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD33P20138 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD33P20138 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD33P20138 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD33P20138 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD33P20138 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD33P20138 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD33P20138 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD33P20138 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD33P20138 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD33P20138 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD33P20138 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CD33P20138 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD33P20138 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD33P20138 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD33P20138 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD33P20138 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CD33P20138 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CD33P20138 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD33P20138 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD33P20138 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD33P20138 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CD33P20138 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD33P20138 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD33P20138 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD33P20138 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD33P20138 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD33P20138 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CD33P20138 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CD33P20138 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CD33P20138 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD33P20138 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD33P20138 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD33P20138 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD33P20138 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD33P20138 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD33P20138 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD33P20138 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD33P20138 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD33P20138 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD33P20138 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD33P20138 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD33P20138 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD33P20138 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD33P20138 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD33P20138 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD33P20138 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD33P20138 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD33P20138 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD33P20138 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD33P20138 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD33P20138 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD33P20138 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD33P20138 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD33P20138 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD33P20138 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CD33P20138 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD33P20138 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD33P20138 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD33P20138 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD33P20138 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CD33P20138 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD33P20138 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD33P20138 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD33P20138 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD33P20138 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms