Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CXCL3P19876 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCL3P19876 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCL3P19876 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCL3P19876 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCL3P19876 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCL3P19876 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCL3P19876 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCL3P19876 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCL3P19876 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCL3P19876 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CXCL3P19876 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CXCL3P19876 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCL3P19876 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCL3P19876 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CXCL3P19876 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CXCL3P19876 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CXCL3P19876 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CXCL3P19876 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CXCL3P19876 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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