Protein–RNA interactions for Protein: P19536

Cox5b, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox5bP19536 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cox5bP19536 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cox5bP19536 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cox5bP19536 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cox5bP19536 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cox5bP19536 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cox5bP19536 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cox5bP19536 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cox5bP19536 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cox5bP19536 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cox5bP19536 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cox5bP19536 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cox5bP19536 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cox5bP19536 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cox5bP19536 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cox5bP19536 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cox5bP19536 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cox5bP19536 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cox5bP19536 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cox5bP19536 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cox5bP19536 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cox5bP19536 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cox5bP19536 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cox5bP19536 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cox5bP19536 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cox5bP19536 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cox5bP19536 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cox5bP19536 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cox5bP19536 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cox5bP19536 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cox5bP19536 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cox5bP19536 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cox5bP19536 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cox5bP19536 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cox5bP19536 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cox5bP19536 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cox5bP19536 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cox5bP19536 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cox5bP19536 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cox5bP19536 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cox5bP19536 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cox5bP19536 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cox5bP19536 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cox5bP19536 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cox5bP19536 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cox5bP19536 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cox5bP19536 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cox5bP19536 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cox5bP19536 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cox5bP19536 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cox5bP19536 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cox5bP19536 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cox5bP19536 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cox5bP19536 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cox5bP19536 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cox5bP19536 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cox5bP19536 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cox5bP19536 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cox5bP19536 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cox5bP19536 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cox5bP19536 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cox5bP19536 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cox5bP19536 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cox5bP19536 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cox5bP19536 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cox5bP19536 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cox5bP19536 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cox5bP19536 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cox5bP19536 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cox5bP19536 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cox5bP19536 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cox5bP19536 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cox5bP19536 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cox5bP19536 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cox5bP19536 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cox5bP19536 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cox5bP19536 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cox5bP19536 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cox5bP19536 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cox5bP19536 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cox5bP19536 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cox5bP19536 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cox5bP19536 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cox5bP19536 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cox5bP19536 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cox5bP19536 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cox5bP19536 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cox5bP19536 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cox5bP19536 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cox5bP19536 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cox5bP19536 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cox5bP19536 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cox5bP19536 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cox5bP19536 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cox5bP19536 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cox5bP19536 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cox5bP19536 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cox5bP19536 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cox5bP19536 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cox5bP19536 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms