Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2CP19387 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR2CP19387 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2CP19387 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2CP19387 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2CP19387 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2CP19387 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR2CP19387 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR2CP19387 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR2CP19387 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR2CP19387 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR2CP19387 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2CP19387 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2CP19387 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2CP19387 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2CP19387 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2CP19387 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2CP19387 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR2CP19387 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR2CP19387 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR2CP19387 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2CP19387 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2CP19387 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2CP19387 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2CP19387 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR2CP19387 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR2CP19387 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR2CP19387 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR2CP19387 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR2CP19387 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR2CP19387 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR2CP19387 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR2CP19387 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR2CP19387 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR2CP19387 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR2CP19387 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2CP19387 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2CP19387 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR2CP19387 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR2CP19387 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR2CP19387 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2CP19387 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2CP19387 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2CP19387 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2CP19387 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2CP19387 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR2CP19387 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR2CP19387 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2CP19387 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2CP19387 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2CP19387 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2CP19387 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2CP19387 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2CP19387 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR2CP19387 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR2CP19387 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR2CP19387 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR2CP19387 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR2CP19387 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR2CP19387 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR2CP19387 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2CP19387 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2CP19387 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2CP19387 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2CP19387 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2CP19387 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2CP19387 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2CP19387 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR2CP19387 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR2CP19387 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR2CP19387 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR2CP19387 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR2CP19387 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR2CP19387 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2CP19387 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2CP19387 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2CP19387 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2CP19387 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2CP19387 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2CP19387 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2CP19387 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2CP19387 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2CP19387 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2CP19387 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2CP19387 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2CP19387 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2CP19387 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2CP19387 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2CP19387 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR2CP19387 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR2CP19387 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR2CP19387 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR2CP19387 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR2CP19387 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2CP19387 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2CP19387 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2CP19387 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2CP19387 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2CP19387 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2CP19387 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms