Protein–RNA interactions for Protein: P19022

CDH2, Cadherin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH2P19022 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH2P19022 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH2P19022 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH2P19022 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH2P19022 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH2P19022 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH2P19022 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDH2P19022 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDH2P19022 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH2P19022 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH2P19022 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH2P19022 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH2P19022 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH2P19022 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH2P19022 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH2P19022 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH2P19022 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH2P19022 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH2P19022 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH2P19022 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH2P19022 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH2P19022 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH2P19022 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH2P19022 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH2P19022 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH2P19022 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH2P19022 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH2P19022 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH2P19022 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH2P19022 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH2P19022 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH2P19022 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH2P19022 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH2P19022 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH2P19022 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH2P19022 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH2P19022 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH2P19022 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH2P19022 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH2P19022 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH2P19022 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH2P19022 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH2P19022 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH2P19022 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH2P19022 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH2P19022 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH2P19022 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH2P19022 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH2P19022 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH2P19022 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH2P19022 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH2P19022 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CDH2P19022 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH2P19022 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH2P19022 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH2P19022 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH2P19022 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH2P19022 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH2P19022 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH2P19022 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH2P19022 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH2P19022 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH2P19022 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH2P19022 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH2P19022 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH2P19022 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH2P19022 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH2P19022 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDH2P19022 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH2P19022 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH2P19022 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH2P19022 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH2P19022 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH2P19022 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH2P19022 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH2P19022 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH2P19022 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH2P19022 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH2P19022 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH2P19022 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH2P19022 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH2P19022 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH2P19022 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH2P19022 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH2P19022 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH2P19022 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH2P19022 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH2P19022 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH2P19022 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH2P19022 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH2P19022 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH2P19022 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH2P19022 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH2P19022 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH2P19022 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH2P19022 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH2P19022 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH2P19022 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH2P19022 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH2P19022 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms