Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cxcl9P18340 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cxcl9P18340 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cxcl9P18340 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cxcl9P18340 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Cxcl9P18340 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cxcl9P18340 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cxcl9P18340 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cxcl9P18340 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cxcl9P18340 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cxcl9P18340 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cxcl9P18340 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cxcl9P18340 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Cxcl9P18340 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cxcl9P18340 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cxcl9P18340 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cxcl9P18340 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cxcl9P18340 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cxcl9P18340 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Cxcl9P18340 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cxcl9P18340 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cxcl9P18340 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cxcl9P18340 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cxcl9P18340 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cxcl9P18340 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cxcl9P18340 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cxcl9P18340 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cxcl9P18340 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cxcl9P18340 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cxcl9P18340 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cxcl9P18340 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Cxcl9P18340 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cxcl9P18340 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cxcl9P18340 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cxcl9P18340 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cxcl9P18340 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Cxcl9P18340 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cxcl9P18340 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cxcl9P18340 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cxcl9P18340 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cxcl9P18340 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cxcl9P18340 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cxcl9P18340 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Cxcl9P18340 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cxcl9P18340 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cxcl9P18340 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cxcl9P18340 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cxcl9P18340 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cxcl9P18340 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Cxcl9P18340 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cxcl9P18340 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Cxcl9P18340 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cxcl9P18340 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cxcl9P18340 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cxcl9P18340 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cxcl9P18340 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cxcl9P18340 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Cxcl9P18340 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cxcl9P18340 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cxcl9P18340 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Cxcl9P18340 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cxcl9P18340 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cxcl9P18340 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cxcl9P18340 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cxcl9P18340 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cxcl9P18340 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cxcl9P18340 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cxcl9P18340 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cxcl9P18340 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cxcl9P18340 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cxcl9P18340 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cxcl9P18340 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Cxcl9P18340 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cxcl9P18340 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cxcl9P18340 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cxcl9P18340 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cxcl9P18340 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Cxcl9P18340 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cxcl9P18340 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cxcl9P18340 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cxcl9P18340 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Cxcl9P18340 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cxcl9P18340 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cxcl9P18340 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Cxcl9P18340 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cxcl9P18340 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cxcl9P18340 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cxcl9P18340 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cxcl9P18340 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Cxcl9P18340 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cxcl9P18340 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cxcl9P18340 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Cxcl9P18340 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cxcl9P18340 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Cxcl9P18340 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cxcl9P18340 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cxcl9P18340 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cxcl9P18340 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cxcl9P18340 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cxcl9P18340 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms