Protein–RNA interactions for Protein: P17948

FLT1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT1P17948 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
FLT1P17948 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
FLT1P17948 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
FLT1P17948 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
FLT1P17948 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
FLT1P17948 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
FLT1P17948 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
FLT1P17948 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
FLT1P17948 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
FLT1P17948 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.11■■■□□ 2.57
FLT1P17948 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
FLT1P17948 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
FLT1P17948 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
FLT1P17948 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
FLT1P17948 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
FLT1P17948 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
FLT1P17948 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
FLT1P17948 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
FLT1P17948 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
FLT1P17948 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
FLT1P17948 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
FLT1P17948 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
FLT1P17948 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
FLT1P17948 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
FLT1P17948 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
FLT1P17948 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
FLT1P17948 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
FLT1P17948 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
FLT1P17948 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
FLT1P17948 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
FLT1P17948 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
FLT1P17948 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
FLT1P17948 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
FLT1P17948 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
FLT1P17948 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
FLT1P17948 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
FLT1P17948 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
FLT1P17948 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
FLT1P17948 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
FLT1P17948 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
FLT1P17948 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
FLT1P17948 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
FLT1P17948 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
FLT1P17948 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
FLT1P17948 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
FLT1P17948 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
FLT1P17948 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
FLT1P17948 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
FLT1P17948 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
FLT1P17948 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
FLT1P17948 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
FLT1P17948 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
FLT1P17948 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
FLT1P17948 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
FLT1P17948 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
FLT1P17948 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
FLT1P17948 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
FLT1P17948 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
FLT1P17948 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
FLT1P17948 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
FLT1P17948 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
FLT1P17948 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
FLT1P17948 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
FLT1P17948 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
FLT1P17948 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
FLT1P17948 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
FLT1P17948 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
FLT1P17948 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
FLT1P17948 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
FLT1P17948 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
FLT1P17948 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
FLT1P17948 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
FLT1P17948 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
FLT1P17948 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
FLT1P17948 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
FLT1P17948 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
FLT1P17948 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
FLT1P17948 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
FLT1P17948 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
FLT1P17948 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
FLT1P17948 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
FLT1P17948 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
FLT1P17948 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
FLT1P17948 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
FLT1P17948 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
FLT1P17948 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
FLT1P17948 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
FLT1P17948 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
FLT1P17948 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
FLT1P17948 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
FLT1P17948 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
FLT1P17948 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
FLT1P17948 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
FLT1P17948 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
FLT1P17948 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
FLT1P17948 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
FLT1P17948 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FLT1P17948 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
FLT1P17948 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FLT1P17948 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms