Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxb1P17919 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxb1P17919 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxb1P17919 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxb1P17919 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxb1P17919 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxb1P17919 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxb1P17919 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxb1P17919 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxb1P17919 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxb1P17919 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxb1P17919 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxb1P17919 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxb1P17919 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxb1P17919 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxb1P17919 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxb1P17919 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxb1P17919 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxb1P17919 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxb1P17919 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxb1P17919 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxb1P17919 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxb1P17919 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxb1P17919 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxb1P17919 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxb1P17919 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxb1P17919 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxb1P17919 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxb1P17919 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxb1P17919 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxb1P17919 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxb1P17919 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxb1P17919 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxb1P17919 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxb1P17919 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxb1P17919 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxb1P17919 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxb1P17919 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxb1P17919 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxb1P17919 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxb1P17919 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxb1P17919 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxb1P17919 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxb1P17919 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Hoxb1P17919 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Hoxb1P17919 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxb1P17919 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxb1P17919 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxb1P17919 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxb1P17919 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxb1P17919 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxb1P17919 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxb1P17919 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxb1P17919 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxb1P17919 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxb1P17919 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxb1P17919 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxb1P17919 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxb1P17919 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxb1P17919 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxb1P17919 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxb1P17919 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxb1P17919 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxb1P17919 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxb1P17919 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxb1P17919 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxb1P17919 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxb1P17919 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxb1P17919 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxb1P17919 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxb1P17919 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxb1P17919 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxb1P17919 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxb1P17919 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxb1P17919 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxb1P17919 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxb1P17919 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxb1P17919 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxb1P17919 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxb1P17919 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxb1P17919 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxb1P17919 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxb1P17919 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxb1P17919 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxb1P17919 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxb1P17919 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxb1P17919 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxb1P17919 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxb1P17919 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxb1P17919 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxb1P17919 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxb1P17919 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxb1P17919 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxb1P17919 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxb1P17919 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxb1P17919 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxb1P17919 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxb1P17919 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxb1P17919 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxb1P17919 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms