Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PcnaP17918 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PcnaP17918 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PcnaP17918 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PcnaP17918 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PcnaP17918 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PcnaP17918 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PcnaP17918 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PcnaP17918 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PcnaP17918 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PcnaP17918 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PcnaP17918 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PcnaP17918 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PcnaP17918 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PcnaP17918 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PcnaP17918 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PcnaP17918 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PcnaP17918 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PcnaP17918 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PcnaP17918 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PcnaP17918 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PcnaP17918 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PcnaP17918 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PcnaP17918 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PcnaP17918 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PcnaP17918 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PcnaP17918 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PcnaP17918 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PcnaP17918 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PcnaP17918 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PcnaP17918 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PcnaP17918 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PcnaP17918 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PcnaP17918 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PcnaP17918 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PcnaP17918 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PcnaP17918 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PcnaP17918 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PcnaP17918 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PcnaP17918 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PcnaP17918 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PcnaP17918 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PcnaP17918 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PcnaP17918 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PcnaP17918 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PcnaP17918 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PcnaP17918 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PcnaP17918 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PcnaP17918 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PcnaP17918 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PcnaP17918 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PcnaP17918 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PcnaP17918 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PcnaP17918 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PcnaP17918 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PcnaP17918 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PcnaP17918 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PcnaP17918 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PcnaP17918 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PcnaP17918 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PcnaP17918 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PcnaP17918 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PcnaP17918 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PcnaP17918 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PcnaP17918 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PcnaP17918 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PcnaP17918 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PcnaP17918 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PcnaP17918 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PcnaP17918 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PcnaP17918 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PcnaP17918 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PcnaP17918 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PcnaP17918 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PcnaP17918 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PcnaP17918 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PcnaP17918 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PcnaP17918 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PcnaP17918 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PcnaP17918 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PcnaP17918 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PcnaP17918 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PcnaP17918 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PcnaP17918 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PcnaP17918 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PcnaP17918 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PcnaP17918 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PcnaP17918 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PcnaP17918 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PcnaP17918 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PcnaP17918 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PcnaP17918 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PcnaP17918 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PcnaP17918 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PcnaP17918 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PcnaP17918 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PcnaP17918 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PcnaP17918 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PcnaP17918 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PcnaP17918 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms