Protein–RNA interactions for Protein: P17540

CKMT2, Creatine kinase S-type, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMT2P17540 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CKMT2P17540 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CKMT2P17540 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CKMT2P17540 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CKMT2P17540 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CKMT2P17540 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CKMT2P17540 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CKMT2P17540 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CKMT2P17540 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CKMT2P17540 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CKMT2P17540 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CKMT2P17540 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CKMT2P17540 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CKMT2P17540 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CKMT2P17540 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CKMT2P17540 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CKMT2P17540 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CKMT2P17540 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CKMT2P17540 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CKMT2P17540 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CKMT2P17540 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CKMT2P17540 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CKMT2P17540 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CKMT2P17540 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CKMT2P17540 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CKMT2P17540 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CKMT2P17540 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CKMT2P17540 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CKMT2P17540 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CKMT2P17540 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CKMT2P17540 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CKMT2P17540 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CKMT2P17540 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CKMT2P17540 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CKMT2P17540 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CKMT2P17540 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CKMT2P17540 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CKMT2P17540 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CKMT2P17540 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CKMT2P17540 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CKMT2P17540 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CKMT2P17540 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CKMT2P17540 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CKMT2P17540 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CKMT2P17540 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CKMT2P17540 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CKMT2P17540 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CKMT2P17540 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CKMT2P17540 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CKMT2P17540 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CKMT2P17540 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CKMT2P17540 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CKMT2P17540 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CKMT2P17540 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CKMT2P17540 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CKMT2P17540 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CKMT2P17540 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CKMT2P17540 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CKMT2P17540 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CKMT2P17540 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CKMT2P17540 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CKMT2P17540 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CKMT2P17540 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CKMT2P17540 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CKMT2P17540 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CKMT2P17540 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CKMT2P17540 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CKMT2P17540 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CKMT2P17540 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CKMT2P17540 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CKMT2P17540 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CKMT2P17540 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CKMT2P17540 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CKMT2P17540 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CKMT2P17540 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CKMT2P17540 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CKMT2P17540 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CKMT2P17540 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CKMT2P17540 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CKMT2P17540 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CKMT2P17540 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CKMT2P17540 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CKMT2P17540 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CKMT2P17540 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CKMT2P17540 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CKMT2P17540 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CKMT2P17540 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CKMT2P17540 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CKMT2P17540 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CKMT2P17540 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CKMT2P17540 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CKMT2P17540 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CKMT2P17540 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CKMT2P17540 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CKMT2P17540 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CKMT2P17540 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CKMT2P17540 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CKMT2P17540 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CKMT2P17540 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CKMT2P17540 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms