Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNB3P16520 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNB3P16520 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNB3P16520 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNB3P16520 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNB3P16520 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNB3P16520 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNB3P16520 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNB3P16520 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GNB3P16520 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GNB3P16520 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GNB3P16520 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GNB3P16520 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GNB3P16520 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GNB3P16520 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GNB3P16520 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GNB3P16520 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GNB3P16520 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GNB3P16520 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GNB3P16520 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GNB3P16520 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GNB3P16520 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GNB3P16520 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GNB3P16520 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GNB3P16520 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GNB3P16520 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GNB3P16520 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GNB3P16520 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GNB3P16520 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GNB3P16520 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GNB3P16520 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GNB3P16520 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GNB3P16520 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GNB3P16520 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GNB3P16520 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GNB3P16520 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GNB3P16520 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GNB3P16520 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GNB3P16520 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GNB3P16520 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GNB3P16520 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GNB3P16520 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GNB3P16520 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GNB3P16520 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GNB3P16520 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GNB3P16520 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GNB3P16520 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GNB3P16520 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GNB3P16520 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GNB3P16520 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GNB3P16520 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GNB3P16520 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GNB3P16520 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GNB3P16520 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GNB3P16520 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GNB3P16520 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GNB3P16520 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GNB3P16520 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GNB3P16520 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GNB3P16520 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GNB3P16520 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GNB3P16520 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GNB3P16520 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GNB3P16520 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GNB3P16520 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GNB3P16520 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GNB3P16520 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GNB3P16520 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GNB3P16520 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GNB3P16520 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GNB3P16520 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GNB3P16520 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GNB3P16520 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GNB3P16520 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GNB3P16520 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GNB3P16520 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GNB3P16520 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GNB3P16520 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GNB3P16520 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GNB3P16520 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GNB3P16520 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GNB3P16520 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GNB3P16520 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GNB3P16520 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GNB3P16520 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GNB3P16520 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GNB3P16520 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GNB3P16520 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GNB3P16520 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GNB3P16520 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GNB3P16520 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GNB3P16520 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GNB3P16520 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GNB3P16520 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GNB3P16520 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GNB3P16520 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GNB3P16520 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GNB3P16520 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GNB3P16520 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GNB3P16520 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms